PCDHGB1

PCDHGB1 (англ. Protocadherin gamma subfamily B, 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 927 амінокислот, а молекулярна маса — 100 360.

PCDHGB1
Ідентифікатори
Символи	PCDHGB1, PCDH-GAMMA-B1, protocadherin gamma subfamily B, 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606299 MGI: 1935169 HomoloGene: 81867 GeneCards: PCDHGB1
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • клітинна мембрана • мембрана • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • growth cone Біологічний процес • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell signaling • нейробіологія розвитку Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56104	93699
Ensembl	ENSG00000254221	ENSMUSG00000103037
UniProt	Q9Y5G3	Q91XX8
RefSeq (мРНК)	NM_032095 NM_018922	NM_033574
RefSeq (білок)	NP_061745 NP_115266	NP_291052
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.35 – 141.51 Mb	Хр. 18: 37.81 – 37.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQRAREAEMM		KSQVLFPFLL		SLFCGAISQQ		IRYTIPEELA		NGSRVGKLAK
DLGLSVRELP		TRKLRVSAED		YFNVSLESGD		LLVNGRIDRE		KICGRKLECA
LEFETVAENP		MNVFHVVVVI		QDINDNAPRF		VAKGIDLEIC		ESALPGVKFS
LDSAQDADVE		GNSLKLYTIN		PNQYFSLSTK		ESPDGSKYPV		LLLEKPLDRE
HQSSHRLILT		AMDGGDPPLS		GTTHIWIRVT		DANDNAPVFS		QEVYRVSLQE
NVPWGTSVLR		VMATDQDEGI		NAEITYAFLN		SPISTSLFNL		NPNTGDITTN
GTLDFEETSR		YVLSVEAKDG		GVHTAHCNVQ		IEIVDENDNA		PEVTFMSFSN
QIPEDSDLGT		VIALIKVRDK		DSGQNGMVTC		YTQEEVPFKL		ESTSKNYYKL
VIAGALNREQ		TADYNVTIIA		TDKGKPALSS		RTSITLHISD		INDNAPVFHQ
ASYVVHVSEN		NPPGASIAQV		SASDPDLGPN		GRVSYSILAS		DLEPRELLSY
VSVSPQSGVV		FAQRAFDHEQ		LRAFELTLQA		RDQGSPALSA		NVSLRVLVGD
LNDNAPRVLY		PALGPDGSAL		FDMVPRAAEP		GYLVTKVVAV		DADSGHNAWL
SYHVLQASEP		GLFSLGLRTG		EVRTARALGD		RDAARQRLLV		AVRDGGQPPL
SATATLHLIF		ADSLQEVLPD		LSDRPEPSDP		QTELQFYLVV		ALALISVLFL
LAVILAIALR		LRRSSSLDTE		GCFQTGLCSK		SGPGVPPNHS		EGTLPYSYNL
CIASHSAKTE		FNSLNLTPEM		APPQDLLCDD		PSMVVCASNE		DHKIAYDPSL
SSHQAPPNTD		WRFSQAQRPG		TSGSQNGDDT		GTWPNNQFDT		EMLQAMILAS
ASEAADGSST		LGGGAGTMGL		SARYGPQFTL		QHVPDYRQNV		YIPGSNATLT
NAAGKRDGKA		PAGGNGNKKK		SGKKEKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5