PCDHGA12

PCDHGA12
Ідентифікатори
Символи	PCDHGA12, CDH21, FIB3, PCDH-GAMMA-A12, protocadherin gamma subfamily A, 12
Зовнішні ІД	OMIM: 603059 MGI: 1935229 HomoloGene: 134588 GeneCards: PCDHGA12
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell-cell junction;
Біологічний процес	• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • адгезія клітин; • cell-cell signaling; • нейробіологія розвитку;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	26025
	93724
	ENSG00000253159
	ENSMUSG00000102428
	O60330
	Q91XY7
	NM_032094; NM_003735
	NM_033595
	NP_003726; NP_115265
	NP_291073
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PCDHGA12 (англ. Protocadherin gamma subfamily A, 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 932 амінокислот, а молекулярна маса — 100 955^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIPARLHRDY	KGLVLLGILL	GTLWETGCTQ	IRYSVPEELE	KGSRVGDISR
DLGLEPRELA	ERGVRIIPRG	RTQLFALNPR	SGSLVTAGRI	DREELCMGAI
KCQLNLDILM	EDKVKIYGVE	VEVRDINDNA	PYFRESELEI	KISENAATEM
RFPLPHAWDP	DIGKNSLQSY	ELSPNTHFSL	IVQNGADGSK	YPELVLKRAL
DREEKAAHHL	VLTASDGGDP	VRTGTARIRV	MVLDANDNAP	AFAQPEYRAS
VPENLALGTQ	LLVVNATDPD	EGVNAEVRYS	FRYVDDKAAQ	VFKLDCNSGT
ISTIGELDHE	ESGFYQMEVQ	AMDNAGYSAR	AKVLITVLDV	NDNAPEVVLT
SLASSVPENS	PRGTLIALLN	VNDQDSEENG	QVICFIQGNL	PFKLEKSYGN
YYSLVTDIVL	DREQVPSYNI	TVTATDRGTP	PLSTETHISL	NVADTNDNPP
VFPQASYSAY	IPENNPRGVS	LVSVTAHDPD	CEENAQITYS	LAENTIQGAS
LSSYVSINSD	TGVLYALSSF	DYEQFRDLQV	KVMARDNGHP	PLSSNVSLSL
FVLDQNDNAP	EILYPALPTD	GSTGVELAPR	SAEPGYLVTK	VVAVDRDSGQ
NAWLSYRLLK	ASEPGLFSVG	LHTGEVRTAR	ALLDRDALKQ	SLVVAVQDHG
QPPLSATVTL	TVAVADSIPQ	VLADLGSLES	PANSETSDLT	LYLVVAVAAV
SCVFLAFVIL	LLALRLRRWH	KSRLLQASGG	GLTGAPASHF	VGVDGVQAFL
QTYSHEVSLT	TDSRKSHLIF	PQPNYADMLV	SQESFEKSEP	LLLSGDSVFS
KDSHGLIEQA	PPNTDWRFSQ	AQRPGTSGSQ	NGDDTGTWPN	NQFDTEMLQA
MILASASEAA	DGSSTLGGGA	GTMGLSARYG	PQFTLQHVPD	YRQNVYIPGS
NATLTNAAGK	RDGKAPAGGN	GNKKKSGKKE	KK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
Matsuyoshi N., Imamura S. (1997). Multiple cadherins are expressed in human fibroblasts. Biochem. Biophys. Res. Commun. 235: 355—358. PMID 9199196 DOI:10.1006/bbrc.1997.6707

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8699 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, O60330 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8699 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O60330 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]