PCDHGA11
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
PCDHGA11 (англ. Protocadherin gamma subfamily A, 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 935 амінокислот, а молекулярна маса — 101 543[4].
PCDHGA11 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PCDHGA11, PCDH-GAMMA-A11, protocadherin gamma subfamily A, 11 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606298 MGI: 1935228 HomoloGene: 110934 GeneCards: PCDHGA11 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 5: 141.42 – 141.51 Mb | Хр. 18: 37.89 – 37.97 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MANRLQRGDR | SRLLLLLCIF | LGTLRGFRAR | QIRYSVPEET | EKGSFVGNIS | ||||
KDLGLEPREL | AKRGVRIVSR | GKTQLFAVNP | RSGSLITAGR | IDREELCETV | ||||
SSCFLNMELL | VEDTLKIYGV | EVEIIDINDN | APSFQEDEVE | IKVSEHAIPG | ||||
ARFALPNARD | PDVGVNSLQS | YQLSPNNYFS | LQLRGRTDGA | KNPELVLEGS | ||||
LDREKEAAHL | LLLTALDGGD | PIRKGAVPIR | VVVLDVNDHI | PMFTQSVYRV | ||||
SVPENISSGT | RVLMVNATDP | DEGINGEVMY | SFRNMESKAS | EIFQLDSQTG | ||||
EVQVRGSLDF | EKYRFYEMEI | QGQDGGGLFT | TTTMLITVVD | VNDNAPEITI | ||||
TSSINSILEN | SPPGTVIALL | NVQDQDSGEN | GQVSCFIPNH | LPFKLEKTYG | ||||
NYYKLITSRV | LDRELVQSYN | ITLTATDQGS | PPLSAETHVW | LNVADDNDNP | ||||
PVFPHSSYSA | YIPENNPRGA | SIFSVTALDP | DSKQNALVTY | SLTDDTVQGV | ||||
PLSSYVSINS | NTGVLYALQS | FDYEQFRDLE | LRVIARDSGD | PPLSSNVSLS | ||||
LFVLDQNDNA | PEILYPALPT | DGSTGVELAP | RSAEPGYLVT | KVVAVDKDSG | ||||
QNAWLSYRLL | KASEPGLFAV | GEHTGEVRTA | RALLDRDALK | QSLVVAVQDH | ||||
GQPPLSATVT | LTVAVADSIP | EVLADLGSLE | SLANSETSDL | SLYLVVAVAA | ||||
VSCIFLVFVI | VLLALRLWRW | HKSRLLQASE | GGLAGMPTSH | FVGVDGVQAF | ||||
LQTYSHEVSL | IADSQKSHLI | FPQPNYGDTL | ISQESCEKSE | PLLIAEDSAI | ||||
ILGKCDPTSN | QQAPPNTDWR | FSQAQRPGTS | GSQNGDDTGT | WPNNQFDTEM | ||||
LQAMILASAS | EAADGSSTLG | GGAGTMGLSA | RYGPQFTLQH | VPDYRQNVYI | ||||
PGSNATLTNA | AGKRDGKAPA | GGNGNKKKSG | KKEKK |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
ред.- Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8698 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y5H2 (англ.) . Архів оригіналу за 6 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |