PCDHB5

PCDHB5
Ідентифікатори
Символи	PCDHB5, PCDH-BETA5, protocadherin beta 5
Зовнішні ІД	OMIM: 606331 MGI: 2136745 HomoloGene: 88834 GeneCards: PCDHB5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • мембрана; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • synapse assembly; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • chemical synaptic transmission; • адгезія клітин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	26167
	93881
	ENSG00000113209
	ENSMUSG00000045657
	Q9Y5E4
	Q91VE5
	NM_015669
	NM_053135
	NP_056484
	NP_444365
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PCDHB5 (англ. Protocadherin beta 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 795 амінокислот, а молекулярна маса — 86 423^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
METALAKTPQ	KRQVMFLAIL	LLLWEAGSEA	VRYSIPEETE	SGYSVANLAK
DLGLGVGELA	TRGARMHYKG	NKELLQLDIK	TGNLLLYEKL	DREVMCGATE
PCILHFQLLL	ENPVQFFQTD	LQLTDINDHA	PEFPEKEMLL	KIPESTQPGT
VFPLKIAQDF	DIGSNTVQNY	TISPNSHFHV	ATHNRGDGRK	YPELVLDKAL
DREERPELSL	TLTALDGGAP	PRSGTTTIRI	VVLDNNDNAP	EFLQSFYEVQ
VPENSPLNSL	VVVVSARDLD	AGAYGSVAYA	LFQGDEVTQP	FVIDEKTAEI
RLKRALDFEA	TPYYNVEIVA	TDGGGLSGKC	TVAIEVVDVN	DNAPELTMST
LSSPTPENAP	ETVVAVFSVS	DPDSGDNGRM	ICSIQNDLPF	LLKPTLKNFY
TLVTQRTLDR	ESQAEYNITI	TVTDMGTPRL	KTEHNITVLV	SDVNDNAPAF
TQTSYTLFVR	ENNSPALHIG	SVSATDRDSG	TNAQVTYSLL	PPQNPHLRLA
SLVSINADNG	HLFALRSLDY	EALQAFEFRV	GATDRGSPAL	SSEALVRVLV
LDANDNSPFV	LYPLQNGSAP	CTELVPRAAE	PGYLVTKVVA	VDGDSGQNAW
LSYQLLKATE	PGLFSMWAHN	GEVRTARLLS	ERDAAKHRLV	VLVKDNGEPP
RSATATLHVL	LVDGFSQPYL	PLPEAAPAQA	QADSLTVYLV	VALASVSSLF
LFSVLLFVAV	RLCRRSRAAS	VGRCSVPEGP	FPGHLVDVSG	TGTLSQSYHY
EVCLTGDSGA	GEFKFLKPII	PNLLPQGAGE	EIGKTAAFRN	SFGLN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8690 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y5E4 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8690 (англ.) . Архів оригіналу за 30 жовтня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y5E4 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]