PCDHA1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
PCDHA1 (англ. Protocadherin alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 950 амінокислот, а молекулярна маса — 102 952[4].
PCDHA1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PCDHA1, PCDH-ALPHA1, Protocadherin alpha 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606307 MGI: 2150982 HomoloGene: 75093 GeneCards: PCDHA1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 5: 140.79 – 141.01 Mb | Хр. 18: 37.06 – 37.32 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MVFSRRGGLG | ARDLLLWLLL | LAAWEVGSGQ | LHYSIPEEAK | HGTFVGRVAQ | ||||
DLGLELAELV | PRLFRVASKT | HRDLLEVNLQ | NGILFVNSRI | DREELCQWSA | ||||
ECSIHLELIA | DRPLQVFHVE | VKVKDINDNP | PVFRGREQII | FIPESRLLNS | ||||
RFPIEGAADA | DIGANALLTY | TLSPSDYFSL | DVEASDELSK | SLWLELRKYL | ||||
DREETPELHL | LLTATDGGKP | ELQGTVELLI | TVLDVNDNAP | LFDQAVYRVH | ||||
LLETTANGTL | VTTLNASDAD | EGVNGEVVFS | FDSGISRDIQ | EKFKVDSSSG | ||||
EIRLIDKLDY | EETKSYEIQV | KAVDKGSPPM | SNHCKVLVKV | LDVNDNAPEL | ||||
AVTSLYLPIR | EDAPLSTVIA | LITVSDRDSG | ANGQVTCSLM | PHVPFKLVST | ||||
FKNYYSLVLD | SALDRESLSV | YELVVTARDG | GSPSLWATAR | VSVEVADVND | ||||
NAPAFAQPEY | TVFVKENNPP | GCHIFTVSAR | DADAQENALV | SYSLVERRVG | ||||
ERALSNYVSV | HAESGKVYAL | QPLDHEELEL | LQFQVSARDA | GVPPLGSNVT | ||||
LQVFVLDEND | NAPALLAPRV | GGTIGAVSEL | VPRLVGAGHV | VAKVRAVDAD | ||||
SGYNAWLSYE | LQPAAGGARI | PFRVGLYTGE | ISTTRVLDEA | DLSRYRLLVL | ||||
VKDHGEPALT | ATATVLVSLV | ESGQAPKASS | RASVGVAGPE | AALVDVNVYL | ||||
IIAICAVSSL | LVLTLLLYTA | LRCSVPPTEG | AYVPGKPTLV | CSSALGSWSN | ||||
SQQRRQRVCS | SEGPPKTDLM | AFSPGLSPSL | NTSERNEQPE | ANLDLSGNPR | ||||
QPNPDWRYSA | SLRAGMHSSV | HLEEAGILRA | GPGGPDQQWP | TVSSATPEPE | ||||
AGEVSPPVGA | GVNSNSWTFK | YGPGNPKQSG | PGELPDKFII | PGSPAIISIR | ||||
QEPTNSQIDK | SDFITFGKKE | ETKKKKKKKK | GNKTQEKKEK | GNSTTDNSDQ | ||||
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
ред.- Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8663 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y5I3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 лютого 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |