PCDH7

PCDH7
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2YST
Ідентифікатори
Символи	PCDH7, BH-Pcdh, BHPCDH, PPP1R120, protocadherin 7
Зовнішні ІД	OMIM: 602988 MGI: 1860487 HomoloGene: 36101 GeneCards: PCDH7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • platelet alpha granule membrane;
Біологічний процес	• адгезія клітин; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • platelet degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5099
	54216
	ENSG00000169851
	ENSMUSG00000029108
	O60245
	н/д
	NM_001173523; NM_002589; NM_032456; NM_032457
	NM_001122758; NM_018764; NM_001310606; NM_001310608
	NP_001166994; NP_002580; NP_115832; NP_115833
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PCDH7 (англ. Protocadherin 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 069 амінокислот, а молекулярна маса — 116 071^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLRMRTAGWA	RGWCLGCCLL	LPLSLSLAAA	KQLLRYRLAE	EGPADVRIGN
VASDLGIVTG	SGEVTFSLES	GSEYLKIDNL	TGELSTSERR	IDREKLPQCQ
MIFDENECFL	DFEVSVIGPS	QSWVDLFEGQ	VIVLDINDNT	PTFPSPVLTL
TVEENRPVGT	LYLLPTATDR	DFGRNGIERY	ELLQEPGGGG	SGGESRRAGA
ADSAPYPGGG	GNGASGGGSG	GSKRRLDASE	GGGGTNPGGR	SSVFELQVAD
TPDGEKQPQL	IVKGALDREQ	RDSYELTLRV	RDGGDPPRSS	QAILRVLITD
VNDNSPRFEK	SVYEADLAEN	SAPGTPILQL	RAADLDVGVN	GQIEYVFGAA
TESVRRLLRL	DETSGWLSVL	HRIDREEVNQ	LRFTVMARDR	GQPPKTDKAT
VVLNIKDEND	NVPSIEIRKI	GRIPLKDGVA	NVAEDVLVDT	PIALVQVSDR
DQGENGVVTC	TVVGDVPFQL	KPASDTEGDQ	NKKKYFLHTS	TPLDYEATRE
FNVVIVAVDS	GSPSLSSNNS	LIVKVGDTND	NPPMFGQSVV	EVYFPENNIP
GERVATVLAT	DADSGKNAEI	AYSLDSSVMG	IFAIDPDSGD	ILVNTVLDRE
QTDRYEFKVN	AKDKGIPVLQ	GSTTVIVQVA	DKNDNDPKFM	QDVFTFYVKE
NLQPNSPVGM	VTVMDADKGR	NAEMSLYIEE	NNNIFSIEND	TGTIYSTMSF
DREHQTTYTF	RVKAVDGGDP	PRSATATVSL	FVMDENDNAP	TVTLPKNISY
TLLPPSSNVR	TVVATVLATD	SDDGINADLN	YSIVGGNPFK	LFEIDPTSGV
VSLVGKLTQK	HYGLHRLVVQ	VNDSGQPSQS	TTTLVHVFVN	ESVSNATAID
SQIARSLHIP	LTQDIAGDPS	YEISKQRLSI	VIGVVAGIMT	VILIILIVVM
ARYCRSKNKN	GYEAGKKDHE	DFFTPQQHDK	SKKPKKDKKN	KKSKQPLYSS
IVTVEASKPN	GQRYDSVNEK	LSDSPSMGRY	RSVNGGPGSP	DLARHYKSSS
PLPTVQLHPQ	SPTAGKKHQA	VQDLPPANTF	VGAGDNISIG	SDHCSEYSCQ
TNNKYSKQMR	LHPYITVFG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Yoshida K., Yoshitomo-Nakagawa K., Seki N., Sasaki M., Sugano S. (1998). Cloning, expression analysis, and chromosomal localization of BH-protocadherin (PCDH7), a novel member of the cadherin superfamily. Genomics. 49: 458—461. PMID 9615233 DOI:10.1006/geno.1998.5271

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8659 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O60245 (англ.) . Архів оригіналу за 12 квітня 2018. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8659 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O60245 (англ.) . Архів оригіналу за 12 квітня 2018. Процитовано 30 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]