PCDH11Y

PCDH11Y (англ. Protocadherin 11 Y-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 340 амінокислот, а молекулярна маса — 146 775.

PCDH11Y
Ідентифікатори
Символи	PCDH11Y, PCDH-PC, PCDH22, PCDHX, PCDHY, protocadherin 11 Y-linked
Зовнішні ІД	OMIM: 400022 GeneCards: PCDH11Y
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • адгезія клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83259	н/д
Ensembl	ENSG00000099715	н/д
UniProt	Q9BZA8	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001278619 NM_032971 NM_032972 NM_032973 NM_001395587	н/д
RefSeq (білок)	NP_001265548 NP_116753 NP_116754 NP_116755	н/д
Локус (UCSC)	Хр. Y: 5 – 5.74 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFRVGFLIIS		SSSSLSPLLL		VSVVRVNTTN		CHKCLLSGTY		IFAVLLVCVV
FHSGAQEKNY		TIREEIPENV		LIGNLLKDLN		LSLIPNKSLT		TTMQFKLVYK
TGDVPLIRIE		EDTGEIFTTG		ARIDREKLCA		GIPRDEHCFY		EVEVAILPDE
IFRLVKIRFL		IEDINDNAPL		FPATVINISI		PENSAINSKY		TLPAAVDPDV
GINGVQNYEL		IKSQNIFGLD		VIETPEGDKM		PQLIVQKELD		REEKDTYVMK
VKVEDGGFPQ		RSSTAILQVS		VTDTNDNHPV		FKETEIEVSI		PENAPVGTSV
TQLHATDADI		GENAKIHFSF		SNLVSNIARR		LFHLNATTGL		ITIKEPLDRE
ETPNHKLLVL		ASDGGLMPAR		AMVLVNVTDV		NDNVPSIDIR		YIVNPVNDTV
VLSENIPLNT		KIALITVTDK		DADHNGRVTC		FTDHEIPFRL		RPVFSNQFLL
ENAAYLDYES		TKEYAIKLLA		ADAGKPPLNQ		SAMLFIKVKD		ENDNAPVFTQ
SFVTVSIPEN		NSPGIQLMKV		SATDADSGPN		AEINYLLGPD		APPEFSLDRR
TGMLTVVKKL		DREKEDKYLF		TILAKDNGVP		PLTSNVTVFV		SIIDQNDNSP
VFTHNEYKFY		VPENLPRHGT		VGLITVTDPD		YGDNSAVTLS		ILDENDDFTI
DSQTGVIRPN		ISFDREKQES		YTFYVKAEDG		GRVSRSSSAK		VTINVVDVND
NKPVFIVPPY		NYSYELVLPS		TNPGTVVFQV		IAVDNDTGMN		AEVRYSIVGG
NTRDLFAIDQ		ETGNITLMEK		CDVTDLGLHR		VLVKANDLGQ		PDSLFSVVIV
NLFVNESVTN		ATLINELVRK		SIEAPVTPNT		EIADVSSPTS		DYVKILVAAV
AGTITVVVVI		FITAVVRCRQ		APHLKAAQKN		MQNSEWATPN		PENRQMIMMK
KKKKKKKHSP		KNLLLNVVTI		EETKADDVDS		DGNRVTLDLP		IDLEEQTMGK
YNWVTTPTTF		KPDSPDLARH		YKSASPQPAF		QIQPETPLNL		KHHIIQELPL
DNTFVACDSI		SNCSSSSSDP		YSVSDCGYPV		TTFEVPVSVH		TRPSQRRVTF
HLPEGSQESS		SDGGLGDHDA		GSLTSTSHGL		PLGYPQEEYF		DRATPSNRTE
GDGNSDPEST		FIPGLKKEIT		VQPTVEEASD		NCTQECLIYG		HSDACWMPAS
LDHSSSSQAQ		ASALCHSPPL		SQASTQHHSP		PVTQTIVLCH		SPPVTQTIAL
CHSPPPIQVS		ALHHSPPLVQ		GTALHHSPPS		AQASALCYSP		PLAQAAAISH
SSSLPQVIAL		HRSQAQSSVS		LQQGWVQGAN		GLCSVDQGVQ		GSATSQFYTM
SERLHPSDDS		IKVIPLTTFA		PRQQARPSRG		DSPIMETHPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Blanco P., Sargent C.A., Boucher C., Mitchell M., Affara N. (2000). Conservation of PCDHX in mammals; expression of human X/Y genes predominantly in brain. Mamm. Genome. 11: 906—914. PMID 11003707 DOI:10.1007/s003350010177
• Blanco-Arias P., Sargent C.A., Affara N.A. (2004). Protocadherin X (PCDHX) and Y (PCDHY) genes; multiple mRNA isoforms encoding variant signal peptides and cytoplasmic domains. Mamm. Genome. 15: 41—52. PMID 14727141 DOI:10.1007/s00335-003-3028-7

Див. також

• Хромосома Y