PCDH1
PCDH1 (англ. Protocadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 060 амінокислот, а молекулярна маса — 114 743[4].
PCDH1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PCDH1, PC42, PCDH42, protocadherin 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603626 MGI: 104692 HomoloGene: 12613 GeneCards: PCDH1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() |
|||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 5: 141.85 – 141.88 Mb | Хр. 18: 38.32 – 38.35 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDSGAGGRRC | PEAALLILGP | PRMEHLRHSP | GPGGQRLLLP | SMLLALLLLL | ||||
APSPGHATRV | VYKVPEEQPP | NTLIGSLAAD | YGFPDVGHLY | KLEVGAPYLR | ||||
VDGKTGDIFT | TETSIDREGL | RECQNQLPGD | PCILEFEVSI | TDLVQNGSPR | ||||
LLEGQIEVQD | INDNTPNFAS | PVITLAIPEN | TNIGSLFPIP | LASDRDAGPN | ||||
GVASYELQAG | PEAQELFGLQ | VAEDQEEKQP | QLIVMGNLDR | ERWDSYDLTI | ||||
KVQDGGSPPR | ASSALLRVTV | LDTNDNAPKF | ERPSYEAELS | ENSPIGHSVI | ||||
QVKANDSDQG | ANAEIEYTFH | QAPEVVRRLL | RLDRNTGLIT | VQGPVDREDL | ||||
STLRFSVLAK | DRGTNPKSAR | AQVVVTVKDM | NDNAPTIEIR | GIGLVTHQDG | ||||
MANISEDVAE | ETAVALVQVS | DRDEGENAAV | TCVVAGDVPF | QLRQASETGS | ||||
DSKKKYFLQT | TTPLDYEKVK | DYTIEIVAVD | SGNPPLSSTN | SLKVQVVDVN | ||||
DNAPVFTQSV | TEVAFPENNK | PGEVIAEITA | SDADSGSNAE | LVYSLEPEPA | ||||
AKGLFTISPE | TGEIQVKTSL | DREQRESYEL | KVVAADRGSP | SLQGTATVLV | ||||
NVLDCNDNDP | KFMLSGYNFS | VMENMPALSP | VGMVTVIDGD | KGENAQVQLS | ||||
VEQDNGDFVI | QNGTGTILSS | LSFDREQQST | YTFQLKAVDG | GVPPRSAYVG | ||||
VTINVLDEND | NAPYITAPSN | TSHKLLTPQT | RLGETVSQVA | AEDFDSGVNA | ||||
ELIYSIAGGN | PYGLFQIGSH | SGAITLEKEI | ERRHHGLHRL | VVKVSDRGKP | ||||
PRYGTALVHL | YVNETLANRT | LLETLLGHSL | DTPLDIDIAG | DPEYERSKQR | ||||
GNILFGVVAG | VVAVALLIAL | AVLVRYCRQR | EAKSGYQAGK | KETKDLYAPK | ||||
PSGKASKGNK | SKGKKSKSPK | PVKPVEDEDE | AGLQKSLKFN | LMSDAPGDSP | ||||
RIHLPLNYPP | GSPDLGRHYR | SNSPLPSIQL | QPQSPSASKK | HQVVQDLPPA | ||||
NTFVGTGDTT | STGSEQYSDY | SYRTNPPKYP | SKQVGQPFQL | STPQPLPHPY | ||||
HGAIWTEVWE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8655 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q08174 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |