PCBP1

PCBP1 (англ. Poly(rC) binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 356 амінокислот, а молекулярна маса — 37 498.

PCBP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WVN, 1ZTG, 3VKE
Ідентифікатори
Символи	PCBP1, HEL-S-85, HNRPE1, HNRPX, hnRNP-E1, hnRNP-X, poly(rC) binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601209 MGI: 1345635 HomoloGene: 68506 GeneCards: PCBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding • nucleic acid binding • single-stranded DNA binding • sequence-specific single stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • екзосома • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • cytoplasmic ribonucleoprotein granule Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • viral RNA genome replication • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5093	23983
Ensembl	ENSG00000169564	ENSMUSG00000051695
UniProt	Q15365	P60335
RefSeq (мРНК)	NM_006196	NM_011865
RefSeq (білок)	NP_006187	NP_035995
Локус (UCSC)	Хр. 2: 70.09 – 70.09 Mb	Хр. 6: 86.5 – 86.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDAGVTESGL		NVTLTIRLLM		HGKEVGSIIG		KKGESVKRIR		EESGARINIS
EGNCPERIIT		LTGPTNAIFK		AFAMIIDKLE		EDINSSMTNS		TAASRPPVTL
RLVVPATQCG		SLIGKGGCKI		KEIRESTGAQ		VQVAGDMLPN		STERAITIAG
VPQSVTECVK		QICLVMLETL		SQSPQGRVMT		IPYQPMPASS		PVICAGGQDR
CSDAAGYPHA		THDLEGPPLD		AYSIQGQHTI		SPLDLAKLNQ		VARQQSHFAM
MHGGTGFAGI		DSSSPEVKGY		WASLDASTQT		THELTIPNNL		IGCIIGRQGA
NINEIRQMSG		AQIKIANPVE		GSSGRQVTIT		GSAASISLAQ		YLINARLSSE
KGMGCS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як реплікація вірусних РНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Leffers H., Dejgaard K., Celis J.E. (1995). Characterisation of two major cellular poly(rC)-binding human proteins, each containing three K-homologous (KH) domains. Eur. J. Biochem. 230: 447—453. PMID 7607214 DOI:10.1111/j.1432-1033.1995.0447h.x
• Aasheim H.-C., Loukianova T., Deggerdal A., Smeland E.B. (1994). Tissue specific expression and cDNA structure of a human transcript encoding a nucleic acid binding [oligo(dC)] protein related to the pre-mRNA binding protein K. Nucleic Acids Res. 22: 959—964. PMID 8152927 DOI:10.1093/nar/22.6.959
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Walter B.L., Parsley T.B., Ehrenfeld E., Semler B.L. (2002). Distinct poly(rC) binding protein KH domain determinants for poliovirus translation initiation and viral RNA replication. J. Virol. 76: 12008—12022. PMID 12414943 DOI:10.1128/JVI.76.23.12008-12022.2002
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Kiledjian M., Wang X., Liebhaber S.A. (1995). Identification of two KH domain proteins in the alpha-globin mRNP stability complex. EMBO J. 14: 4357—4364. PMID 7556077

Див. також

• Хромосома 2