PARL

PARL (англ. Presenilin associated rhomboid like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 379 амінокислот, а молекулярна маса — 42 190.

PARL
Ідентифікатори
Символи	PARL, PSARL, PSARL1, PSENIP2, RHBDS1, PRO2207, presenilin associated rhomboid like
Зовнішні ІД	OMIM: 607858 MGI: 1277152 HomoloGene: 10239 GeneCards: PARL
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • serine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • serine-type endopeptidase activity • endopeptidase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мітохондріальна внутрішня мембрана • мембрана • клітинне ядро • мітохондрія Біологічний процес • GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process • regulation of protein targeting to mitochondrion • regulation of proteolysis • протеоліз • membrane protein proteolysis • regulation of mitochondrion organization • mitochondrial calcium ion transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55486	381038
Ensembl	ENSG00000175193	ENSMUSG00000033918
UniProt	Q9H300	Q5XJY4
RefSeq (мРНК)	NM_001037639 NM_001037640 NM_018622 NM_001324436 NM_001324437 NM_001324438	NM_001005767
RefSeq (білок)	NP_001032728 NP_001311365 NP_001311366 NP_001311367 NP_061092	NP_001005767
Локус (UCSC)	Хр. 3: 183.83 – 183.88 Mb	Хр. 16: 20.1 – 20.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAWRGWAQRG		WGCGQAWGAS		VGGRSCEELT		AVLTPPQLLG		RRFNFFIQQK
CGFRKAPRKV		EPRRSDPGTS		GEAYKRSALI		PPVEETVFYP		SPYPIRSLIK
PLFFTVGFTG		CAFGSAAIWQ		YESLKSRVQS		YFDGIKADWL		DSIRPQKEGD
FRKEINKWWN		NLSDGQRTVT		GIIAANVLVF		CLWRVPSLQR		TMIRYFTSNP
ASKVLCSPML		LSTFSHFSLF		HMAANMYVLW		SFSSSIVNIL		GQEQFMAVYL
SAGVISNFVS		YVGKVATGRY		GPSLGASGAI		MTVLAAVCTK		IPEGRLAIIF
LPMFTFTAGN		ALKAIIAMDT		AGMILGWKFF		DHAAHLGGAL		FGIWYVTYGH
ELIWKNREPL		VKIWHEIRTN		GPKKGGGSK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sik A., Passer B.J., Koonin E.V., Pellegrini L. (2004). Self-regulated cleavage of the mitochondrial intramembrane-cleaving protease PARL yields Pbeta, a nuclear-targeted peptide. J. Biol. Chem. 279: 15323—15329. PMID 14732705 DOI:10.1074/jbc.M313756200

Див. також

• Хромосома 3