PAPD4

PAPD4 (англ. Poly(A) RNA polymerase D4, non-canonical) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 484 амінокислот, а молекулярна маса — 56 028.

PAPD4
Ідентифікатори
Символи	TENT2, GLD2, TUT2, PAP associated domain containing 4, poly(A) RNA polymerase D4, non-canonical, PAPD4, terminal nucleotidyltransferase 2, APD4, GLD-2
Зовнішні ІД	OMIM: 614121 MGI: 2140950 HomoloGene: 44022 GeneCards: TENT2
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • polynucleotide adenylyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • зв'язування з іоном металу • 5'-3' RNA polymerase activity • adenylyltransferase activity Клітинна компонента • nuclear RNA-directed RNA polymerase complex • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • histone mRNA catabolic process • mRNA processing • RNA polyadenylation • hematopoietic progenitor cell differentiation • hippocampus development • neuron differentiation • retina development in camera-type eye • dark adaptation • RNA stabilization • negative regulation of miRNA catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	167153	100715
Ensembl	ENSG00000164329	н/д
UniProt	Q6PIY7	Q91YI6
RefSeq (мРНК)	NM_001114393 NM_001114394 NM_001297744 NM_001297745 NM_173797 NM_001349548 NM_001349549 NM_001349550 NM_001349551 NM_001349552 NM_001349553 NM_001349554	NM_133905 NM_001361536 NM_001361537
RefSeq (білок)	NP_001107865 NP_001107866 NP_001284673 NP_001284674 NP_776158 NP_001336477 NP_001336478 NP_001336479 NP_001336480 NP_001336481 NP_001336482 NP_001336483	NP_598666 NP_001348465 NP_001348466
Локус (UCSC)	Хр. 5: 79.61 – 79.69 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFPNSILGRP		PFTPNHQQHN		NFFTLSPTVY		SHQQLIDAQF		NFQNADLSRA
VSLQQLTYGN		VSPIQTSASP		LFRGRKRLSD		EKNLPLDGKR		QRFHSPHQEP
TVVNQIVPLS		GERRYSMPPL		FHTHYVPDIV		RCVPPFREIA		FLEPREITLP
EAKDKLSQQI		LELFETCQQQ		ISDLKKKELC		RTQLQREIQL		LFPQSRLFLV
GSSLNGFGTR		SSDGDLCLVV		KEEPCFFQVN		QKTEARHILT		LVHKHFCTRL
SGYIERPQLI		RAKVPIVKFR		DKVSCVEFDL		NVNNIVGIRN		TFLLRTYAYL
ENRVRPLVLV		IKKWASHHQI		NDASRGTLSS		YSLVLMVLHY		LQTLPEPILP
SLQKIYPESF		SPAIQLHLVH		QAPCNVPPYL		SKNESNLGDL		LLGFLKYYAT
EFDWNSQMIS		VREAKAIPRP		DGIEWRNKYI		CVEEPFDGTN		TARAVHEKQK
FDMIKDQFLK		SWHRLKNKRD		LNSILPVRAA		VLKR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kwak J.E., Wang L., Ballantyne S., Kimble J., Wickens M. (2004). Mammalian GLD-2 homologs are poly(A) polymerases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 4407—4412. PMID 15070731 DOI:10.1073/pnas.0400779101
• Mullen T.E., Marzluff W.F. (2008). Degradation of histone mRNA requires oligouridylation followed by decapping and simultaneous degradation of the mRNA both 5' to 3' and 3' to 5'. Genes Dev. 22: 50—65. PMID 18172165 DOI:10.1101/gad.1622708

Див. також

• Хромосома 5