PAMR1

PAMR1 (англ. Peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 720 амінокислот, а молекулярна маса — 80 199.

PAMR1
Ідентифікатори
Символи	PAMR1, DKFZP586H2123, RAMP, FP938, peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1
Зовнішні ІД	MGI: 2445082 HomoloGene: 9134 GeneCards: PAMR1
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25891	210622
Ensembl	ENSG00000149090	ENSMUSG00000027188
UniProt	Q6UXH9	Q8BU25
RefSeq (мРНК)	NM_015430 NM_001001991 NM_001282675 NM_001282676	NM_173749
RefSeq (білок)	NP_001001991 NP_001269604 NP_001269605 NP_056245	NP_776110
Локус (UCSC)	Хр. 11: 35.43 – 35.53 Mb	Хр. 2: 102.38 – 102.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELGCWTQLG		LTFLQLLLIS		SLPREYTVIN		EACPGAEWNI		MCRECCEYDQ
IECVCPGKRE		VVGYTIPCCR		NEENECDSCL		IHPGCTIFEN		CKSCRNGSWG
GTLDDFYVKG		FYCAECRAGW		YGGDCMRCGQ		VLRAPKGQIL		LESYPLNAHC
EWTIHAKPGF		VIQLRFVMLS		LEFDYMCQYD		YVEVRDGDNR		DGQIIKRVCG
NERPAPIQSI		GSSLHVLFHS		DGSKNFDGFH		AIYEEITACS		SSPCFHDGTC
VLDKAGSYKC		ACLAGYTGQR		CENLLEERNC		SDPGGPVNGY		QKITGGPGLI
NGRHAKIGTV		VSFFCNNSYV		LSGNEKRTCQ		QNGEWSGKQP		ICIKACREPK
ISDLVRRRVL		PMQVQSRETP		LHQLYSAAFS		KQKLQSAPTK		KPALPFGDLP
MGYQHLHTQL		QYECISPFYR		RLGSSRRTCL		RTGKWSGRAP		SCIPICGKIE
NITAPKTQGL		RWPWQAAIYR		RTSGVHDGSL		HKGAWFLVCS		GALVNERTVV
VAAHCVTDLG		KVTMIKTADL		KVVLGKFYRD		DDRDEKTIQS		LQISAIILHP
NYDPILLDAD		IAILKLLDKA		RISTRVQPIC		LAASRDLSTS		FQESHITVAG
WNVLADVRSP		GFKNDTLRSG		VVSVVDSLLC		EEQHEDHGIP		VSVTDNMFCA
SWEPTAPSDI		CTAETGGIAA		VSFPGRASPE		PRWHLMGLVS		WSYDKTCSHR
LSTAFTKVLP		FKDWIERNMK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гомологів серинових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11