PAF1

PAF1 (англ. PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 531 амінокислот, а молекулярна маса — 59 976.

PAF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4M6T
Ідентифікатори
Символи	PAF1, F23149_1, PD2, PAF1 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 610506 MGI: 1923988 HomoloGene: 5441 GeneCards: PAF1
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA polymerase II complex binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • Міжклітинні контакти • Cdc73/Paf1 complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма Біологічний процес • histone monoubiquitination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of histone methylation • positive regulation of mRNA 3'-end processing • GO:0071110, GO:0036413, GO:0036414 histone modification • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Wnt signaling pathway • transcription, DNA-templated • stem cell population maintenance • mRNA polyadenylation • endodermal cell fate commitment • protein localization to nucleus • histone H2B ubiquitination • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of myeloid cell differentiation • positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of cell cycle G1/S phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54623	54624
Ensembl	ENSG00000006712	ENSMUSG00000003437
UniProt	Q8N7H5	Q8K2T8
RefSeq (мРНК)	NM_001256826 NM_019088	NM_019458
RefSeq (білок)	NP_001243755 NP_061961	NP_062331
Локус (UCSC)	Хр. 19: 39.39 – 39.39 Mb	Хр. 7: 28.09 – 28.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPTIQTQAQ		REDGHRPNSH		RTLPERSGVV		CRVKYCNSLP		DIPFDPKFIT
YPFDQNRFVQ		YKATSLEKQH		KHDLLTEPDL		GVTIDLINPD		TYRIDPNVLL
DPADEKLLEE		EIQAPTSSKR		SQQHAKVVPW		MRKTEYISTE		FNRYGISNEK
PEVKIGVSVK		QQFTEEEIYK		DRDSQITAIE		KTFEDAQKSI		SQHYSKPRVT
PVEVMPVFPD		FKMWINPCAQ		VIFDSDPAPK		DTSGAAALEM		MSQAMIRGMM
DEEGNQFVAY		FLPVEETLKK		RKRDQEEEMD		YAPDDVYDYK		IAREYNWNVK
NKASKGYEEN		YFFIFREGDG		VYYNELETRV		RLSKRRAKAG		VQSGTNALLV
VKHRDMNEKE		LEAQEARKAQ		LENHEPEEEE		EEEMETEEKE		AGGSDEEQEK
GSSSEKEGSE		DEHSGSESER		EEGDRDEASD		KSGSGEDESS		EDEARAARDK
EEIFGSDADS		EDDADSDDED		RGQAQGGSDN		DSDSGSNGGG		QRSRSHSRSA
SPFPSGSEHS		AQEDGSEAAA		SDSSEADSDS		D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kim J., Guermah M., Roeder R.G. (2010). The human PAF1 complex acts in chromatin transcription elongation both independently and cooperatively with SII/TFIIS. Cell. 140: 491—503. PMID 20178742 DOI:10.1016/j.cell.2009.12.050

Див. також

• Хромосома 19