PADI4

PADI4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WD8, 1WD9, 1WDA, 2DEW, 2DEX, 2DEY, 2DW5, 3APM, 3APN, 3B1T, 3B1U, 4DKT, 4X8C, 4X8G
Ідентифікатори
Символи	PADI4, PAD, PAD4, PADI5, PDI4, PDI5, peptidyl arginine deiminase 4
Зовнішні ІД	OMIM: 605347 MGI: 1338898 HomoloGene: 7883 GeneCards: PADI4
шифр КФ	3.5.3.15
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • arginine deiminase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • protein-arginine deiminase activity; • calcium ion binding; • arginine binding; • protein homodimerization activity;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • цитоплазма; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• ремоделювання хроматину; • nucleosome assembly; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • процес імунної системи; • transcription, DNA-templated; • stem cell population maintenance; • вроджений імунітет; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • arginine deiminase pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	23569
	18602
	ENSG00000280908; ENSG00000159339
	ENSMUSG00000025330
	Q9UM07
	Q9Z183
	NM_012387
	NM_011061
	NP_036519
	NP_035191
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PADI4 (англ. Peptidyl arginine deiminase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 663 амінокислот, а молекулярна маса — 74 079^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQGTLIRVT	PEQPTHAVCV	LGTLTQLDIC	SSAPEDCTSF	SINASPGVVV
DIAHGPPAKK	KSTGSSTWPL	DPGVEVTLTM	KVASGSTGDQ	KVQISYYGPK
TPPVKALLYL	TGVEISLCAD	ITRTGKVKPT	RAVKDQRTWT	WGPCGQGAIL
LVNCDRDNLE	SSAMDCEDDE	VLDSEDLQDM	SLMTLSTKTP	KDFFTNHTLV
LHVARSEMDK	VRVFQATRGK	LSSKCSVVLG	PKWPSHYLMV	PGGKHNMDFY
VEALAFPDTD	FPGLITLTIS	LLDTSNLELP	EAVVFQDSVV	FRVAPWIMTP
NTQPPQEVYA	CSIFENEDFL	KSVTTLAMKA	KCKLTICPEE	ENMDDQWMQD
EMEIGYIQAP	HKTLPVVFDS	PRNRGLKEFP	IKRVMGPDFG	YVTRGPQTGG
ISGLDSFGNL	EVSPPVTVRG	KEYPLGRILF	GDSCYPSNDS	RQMHQALQDF
LSAQQVQAPV	KLYSDWLSVG	HVDEFLSFVP	APDRKGFRLL	LASPRSCYKL
FQEQQNEGHG	EALLFEGIKK	KKQQKIKNIL	SNKTLREHNS	FVERCIDWNR
ELLKRELGLA	ESDIIDIPQL	FKLKEFSKAE	AFFPNMVNML	VLGKHLGIPK
PFGPVINGRC	CLEEKVCSLL	EPLGLQCTFI	NDFFTYHIRH	GEVHCGTNVR
RKPFSFKWWN	MVP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee Y.-H., Coonrod S.A., Kraus W.L., Jelinek M.A., Stallcup M.R. (2005). Regulation of coactivator complex assembly and function by protein arginine methylation and demethylimination. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 3611—3616. PMID 15731352 DOI:10.1073/pnas.0407159102
Neeli I., Khan S.N., Radic M. (2008). Histone deimination as a response to inflammatory stimuli in neutrophils. J. Immunol. 180: 1895—1902. PMID 18209087 DOI:10.4049/jimmunol.180.3.1895
Asaga H., Nakashima K., Senshu T., Ishigami A., Yamada M. (2001). Immunocytochemical localization of peptidylarginine deiminase in human eosinophils and neutrophils. J. Leukoc. Biol. 70: 46—51. PMID 11435484