PACSIN1

PACSIN1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3HAH, 3HAI, 3Q84, 3QNI
Ідентифікатори
Символи	PACSIN1, SDPI, protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606512 MGI: 1345181 HomoloGene: 22674 GeneCards: PACSIN1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytoskeletal protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • phospholipid binding; • lipid binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • axon terminus; • гіалоплазма; • ендосома; • cell projection; • мембрана; • myelin sheath; • клітинна мембрана; • синапс; • ruffle membrane; • міжклітинні контакти; • perinuclear region of cytoplasm; • neuron projection; • cytoplasmic vesicle membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • COPI-coated vesicle; • цитоскелет; • photoreceptor ribbon synapse; • presynaptic endocytic zone;
Біологічний процес	• regulation of endocytosis; • negative regulation of endocytosis; • protein localization to membrane; • neuron projection morphogenesis; • ендоцитоз; • actin filament organization; • neuron development; • positive regulation of dendrite development; • plasma membrane tubulation; • synaptic vesicle endocytosis; • protein localization to plasma membrane; • cytoskeleton organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	29993
	23969
	ENSG00000124507
	ENSMUSG00000040276
	Q9BY11
	Q61644
	NM_001199583; NM_020804
	NM_001286743; NM_001286744; NM_011861; NM_178365
	NP_001186512; NP_065855
	NP_001273672; NP_001273673; NP_035991; NP_848142
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PACSIN1 (англ. Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 444 амінокислот, а молекулярна маса — 50 966^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSSYDEASL	APEETTDSFW	EVGNYKRTVK	RIDDGHRLCN	DLMNCVQERA
KIEKAYGQQL	TDWAKRWRQL	IEKGPQYGSL	ERAWGAIMTE	ADKVSELHQE
VKNNLLNEDL	EKVKNWQKDA	YHKQIMGGFK	ETKEAEDGFR	KAQKPWAKKM
KELEAAKKAY	HLACKEEKLA	MTREMNSKTE	QSVTPEQQKK	LQDKVDKCKQ
DVQKTQEKYE	KVLEDVGKTT	PQYMENMEQV	FEQCQQFEEK	RLVFLKEVLL
DIKRHLNLAE	NSSYIHVYRE	LEQAIRGADA	QEDLRWFRST	SGPGMPMNWP
QFEEWNPDLP	HTTTKKEKQP	KKAEGVALTN	ATGAVESTSQ	AGDRGSVSSY
DRGQPYATEW	SDDESGNPFG	GSETNGGANP	FEDDSKGVRV	RALYDYDGQE
QDELSFKAGD	ELTKLGEEDE	QGWCRGRLDS	GQLGLYPANY	VEAI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ендоцитоз. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

Sumoy L., Pluvinet R., Andreu N., Estivill X., Escarceller M. (2001). PACSIN 3 is a novel SH3 domain cytoplasmic adapter protein of the pacsin-syndapin-FAP52 gene family. Gene. 262: 199—205. PMID 11179684 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00531-X
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Goh S.L., Wang Q., Byrnes L.J., Sondermann H. (2012). Versatile membrane deformation potential of activated pacsin. PLoS ONE. 7: E51628—E51628. PMID 23236520 DOI:10.1371/journal.pone.0051628
Bai X., Meng G., Luo M., Zheng X. (2012). Rigidity of wedge loop in PACSIN 3 protein is a key factor in dictating diameters of tubules. J. Biol. Chem. 287: 22387—22396. PMID 22573331 DOI:10.1074/jbc.M112.358960

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8570 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BY11 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8570 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9BY11 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]