PACS1

PACS1
Ідентифікатори
Символи	PACS1, MRD17, phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, SHMS
Зовнішні ІД	OMIM: 607492 MGI: 1277113 HomoloGene: 9970 GeneCards: PACS1
Пов'язані генетичні захворювання
	morbid obesity, Schuurs-Hoeijmakers Syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transmembrane transporter binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • комплекс Ґольджі; • COPI-coated vesicle;
Біологічний процес	• GO:0019049, GO:0030683 mitigation of host defenses by virus; • GO:0022415 viral process; • protein localization to plasma membrane; • protein localization to Golgi apparatus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	55690
	107975
	ENSG00000175115
	ENSMUSG00000024855
	Q6VY07
	Q8K212
	NM_018026; NM_178178
	NM_153129; NM_001362451
	NP_060496; NP_060496.2
NP_694769; NP_001349380; NP_001390495; NP_001390496; NP_001390497;
	NP_001390498
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PACS1 (англ. Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 104 898^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAERGGAGGG	PGGAGGGSGQ	RGSGVAQSPQ	QPPPQQQQQQ	PPQQPTPPKL
AQATSSSSST	SAAAASSSSS	STSTSMAVAV	ASGSAPPGGP	GPGRTPAPVQ
MNLYATWEVD	RSSSSCVPRL	FSLTLKKLVM	LKEMDKDLNS	VVIAVKLQGS
KRILRSNEIV	LPASGLVETE	LQLTFSLQYP	HFLKRDANKL	QIMLQRRKRY
KNRTILGYKT	LAVGLINMAE	VMQHPNEGAL	VLGLHSNVKD	VSVPVAEIKI
YSLSSQPIDH	EGIKSKLSDR	SPDIDNYSEE	EEESFSSEQE	GSDDPLHGQD
LFYEDEDLRK	VKKTRRKLTS	TSAITRQPNI	KQKFVALLKR	FKVSDEVGFG
LEHVSREQIR	EVEEDLDELY	DSLEMYNPSD	SGPEMEETES	ILSTPKPKLK
PFFEGMSQSS	SQTEIGSLNS	KGSLGKDTTS	PMELAALEKI	KSTWIKNQDD
SLTETDTLEI	TDQDMFGDAS	TSLVVPEKVK	TPMKSSKTDL	QGSASPSKVE
GVHTPRQKRS	TPLKERQLSK	PLSERTNSSD	SERSPDLGHS	TQIPRKVVYD
QLNQILVSDA	ALPENVILVN	TTDWQGQYVA	ELLQDQRKPV	VCTCSTVEVQ
AVLSALLTRI	QRYCNCNSSM	PRPVKVAAVG	GQSYLSSILR	FFVKSLANKT
SDWLGYMRFL	IIPLGSHPVA	KYLGSVDSKY	SSSFLDSGWR	DLFSRSEPPV
SEQLDVAGRV	MQYVNGAATT	HQLPVAEAML	TCRHKFPDED	SYQKFIPFIG
VVKVGLVEDS	PSTAGDGDDS	PVVSLTVPST	SPPSSSGLSR	DATATPPSSP
SMSSALAIVG	SPNSPYGDVI	GLQVDYWLGH	PGERRREGDK	RDASSKNTLK
SVFRSVQVSR	LPHSGEAQLS	GTMAMTVVTK	EKNKKVPTIF	LSKKPREKEV
DSKSQVIEGI	SRLICSAKQQ	QTMLRVSIDG	VEWSDIKFFQ	LAAQWPTHVK
HFPVGLFSGS	KAT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у апараті гольджі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Blagoveshchenskaya A.D., Thomas L., Feliciangeli S.F., Hung C.-H., Thomas G. (2002). HIV-1 Nef downregulates MHC-I by a PACS-1- and PI3K-regulated ARF6 endocytic pathway. Cell. 111: 853—866. PMID 12526811 DOI:10.1016/S0092-8674(02)01162-5