PABPC4

PABPC4 (англ. Poly(A) binding protein cytoplasmic 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 644 амінокислот, а молекулярна маса — 70 783.

PABPC4
Ідентифікатори
Символи	PABPC4, APP-1, APP1, PABP4, iPABP, poly(A) binding protein cytoplasmic 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603407 MGI: 2385206 HomoloGene: 37855 GeneCards: PABPC4
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • poly(C) RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • poly(A) binding • nucleic acid binding • poly(U) RNA binding • RNA binding • mRNA binding • mRNA 3'-UTR binding Клітинна компонента • cytoplasmic stress granule • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • Деградація РНК • зсідання крові • Біосинтез білків • regulation of mRNA stability • myeloid cell development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8761	230721
Ensembl	ENSG00000090621	ENSMUSG00000011257
UniProt	Q13310	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_003819 NM_001135653 NM_001135654	NM_130881 NM_148917 NM_001356377
RefSeq (білок)	NP_001129125 NP_001129126 NP_003810	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 39.56 – 39.58 Mb	Хр. 4: 123.16 – 123.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNAAASSYPM		ASLYVGDLHS		DVTEAMLYEK		FSPAGPVLSI		RVCRDMITRR
SLGYAYVNFQ		QPADAERALD		TMNFDVIKGK		PIRIMWSQRD		PSLRKSGVGN
VFIKNLDKSI		DNKALYDTFS		AFGNILSCKV		VCDENGSKGY		AFVHFETQEA
ADKAIEKMNG		MLLNDRKVFV		GRFKSRKERE		AELGAKAKEF		TNVYIKNFGE
EVDDESLKEL		FSQFGKTLSV		KVMRDPNGKS		KGFGFVSYEK		HEDANKAVEE
MNGKEISGKI		IFVGRAQKKV		ERQAELKRKF		EQLKQERISR		YQGVNLYIKN
LDDTIDDEKL		RKEFSPFGSI		TSAKVMLEDG		RSKGFGFVCF		SSPEEATKAV
TEMNGRIVGS		KPLYVALAQR		KEERKAHLTN		QYMQRVAGMR		ALPANAILNQ
FQPAAGGYFV		PAVPQAQGRP		PYYTPNQLAQ		MRPNPRWQQG		GRPQGFQGMP
SAIRQSGPRP		TLRHLAPTGS		ECPDRLAMDF		GGAGAAQQGL		TDSCQSGGVP
TAVQNLAPRA		AVAAAAPRAV		APYKYASSVR		SPHPAIQPLQ		APQPAVHVQG
QEPLTASMLA		AAPPQEQKQM		LGERLFPLIQ		TMHSNLAGKI		TGMLLEIDNS
ELLHMLESPE		SLRSKVDEAV		AVLQAHHAKK		EAAQKVGAVA		AATS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Yang H., Duckett C.S., Lindsten T. (1995). iPABP, an inducible poly(A)-binding protein detected in activated human T cells. Mol. Cell. Biol. 15: 6770—6776. PMID 8524242 DOI:10.1128/MCB.15.12.6770
• Houng A.K., Maggini L., Clement C.Y., Reed G.L. (1997). Identification and structure of activated-platelet protein-1, a protein with RNA-binding domain motifs that is expressed by activated platelets. Eur. J. Biochem. 243: 209—218. PMID 9030741 DOI:10.1111/j.1432-1033.1997.0209a.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1