PABPC3

PABPC3 (англ. Poly(A) binding protein cytoplasmic 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 631 амінокислот, а молекулярна маса — 70 031.

PABPC3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4IVE
Ідентифікатори
Символи	PABPC3, PABP3, PABPL3, tPABP, poly(A) binding protein cytoplasmic 3
Зовнішні ІД	OMIM: 604680 HomoloGene: 118007 GeneCards: PABPC3
Онтологія гена Молекулярна функція • poly(A) binding • RNA binding • nucleic acid binding • mRNA 3'-UTR binding • poly(U) RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • екзосома • гіалоплазма • клітинне ядро • cytoplasmic stress granule • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • mRNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5042	606498
Ensembl	ENSG00000151846	ENSDARG00000017219
UniProt	Q9H361	F1QB54
RefSeq (мРНК)	NM_030979	NM_001031676
RefSeq (білок)	NP_112241	NP_001026846
Локус (UCSC)	Хр. 13: 25.1 – 25.1 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNPSTPSYPT		ASLYVGDLHP		DVTEAMLYEK		FSPAGPILSI		RICRDLITSG
SSNYAYVNFQ		HTKDAEHALD		TMNFDVIKGK		PVRIMWSQRD		PSLRKSGVGN
IFVKNLDKSI		NNKALYDTVS		AFGNILSCNV		VCDENGSKGY		GFVHFETHEA
AERAIKKMNG		MLLNGRKVFV		GQFKSRKERE		AELGARAKEF		PNVYIKNFGE
DMDDERLKDL		FGKFGPALSV		KVMTDESGKS		KGFGFVSFER		HEDAQKAVDE
MNGKELNGKQ		IYVGRAQKKV		ERQTELKRTF		EQMKQDRITR		YQVVNLYVKN
LDDGIDDERL		RKAFSPFGTI		TSAKVMMEGG		RSKGFGFVCF		SSPEEATKAV
TEMNGRIVAT		KPLYVALAQR		KEERQAYLTN		EYMQRMASVR		AVPNQRAPPS
GYFMTAVPQT		QNHAAYYPPS		QIARLRPSPR		WTAQGARPHP		FQNKPSAIRP
GAPRVPFSTM		RPASSQVPRV		MSTQRVANTS		TQTVGPRPAA		AAAAAATPAV
RTVPRYKYAA		GVRNPQQHRN		AQPQVTMQQL		AVHVQGQETL		TASRLASAPP
QKQKQMLGER		LFPLIQAMHP		TLAGKITGML		LEIDNSELLY		MLESPESLRS
KVDEAVAVLQ		AHQAKEATQK		AVNSATGVPT		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Feral C., Guellaen G., Pawlak A. (2001). Human testis expresses a specific poly(A)-binding protein. Nucleic Acids Res. 29: 1872—1883. PMID 11328870 DOI:10.1093/nar/29.9.1872
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13