NUP93

NUP93 (англ. Nucleoporin 93) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 819 амінокислот, а молекулярна маса — 93 488.

NUP93
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IJN, 5IJO
Ідентифікатори
Символи	NUP93, NIC96, NPHS12, nucleoporin 93kDa, nucleoporin 93
Зовнішні ІД	OMIM: 614351 MGI: 1919055 HomoloGene: 40971 GeneCards: NUP93
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Ядерна мембрана • мембрана • nuclear periphery • Ядерна пора • клітинне ядро • nuclear envelope • host cell Біологічний процес • mRNA transport • viral transcription • protein sumoylation • mitotic nuclear membrane disassembly • regulation of cellular response to heat • protein transport • GO:0022415 viral process • GO:0046795 intracellular transport of virus • nuclear pore complex assembly • negative regulation of hydrogen peroxide-induced cell death • tRNA export from nucleus • glomerular visceral epithelial cell migration • nuclear envelope organization • mRNA export from nucleus • renal system development • positive regulation of SMAD protein signal transduction • SMAD protein signal transduction • glomerular visceral epithelial cell development • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • poly(A)+ mRNA export from nucleus • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • protein import into nucleus • nucleocytoplasmic transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9688	71805
Ensembl	ENSG00000102900	ENSMUSG00000032939
UniProt	Q8N1F7	Q8BJ71
RefSeq (мРНК)	NM_001242795 NM_001242796 NM_014669	NM_172410 NM_001357266 NM_001357267 NM_001357268
RefSeq (білок)	NP_001229724 NP_001229725 NP_055484	NP_765998 NP_001344195 NP_001344196 NP_001344197
Локус (UCSC)	Хр. 16: 56.73 – 56.85 Mb	Хр. 8: 94.94 – 95.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDTEGFGELL		QQAEQLAAET		EGISELPHVE		RNLQEIQQAG		ERLRSRTLTR
TSQETADVKA		SVLLGSRGLD		ISHISQRLES		LSAATTFEPL		EPVKDTDIQG
FLKNEKDNAL		LSAIEESRKR		TFGMAEEYHR		ESMLVEWEQV		KQRILHTLLA
SGEDALDFTQ		ESEPSYISDV		GPPGRSSLDN		IEMAYARQIY		IYNEKIVNGH
LQPNLVDLCA		SVAELDDKSI		SDMWTMVKQM		TDVLLTPATD		ALKNRSSVEV
RMEFVRQALA		YLEQSYKNYT		LVTVFGNLHQ		AQLGGVPGTY		QLVRSFLNIK
LPAPLPGLQD		GEVEGHPVWA		LIYYCMRCGD		LLAASQVVNR		AQHQLGEFKT
WFQEYMNSKD		RRLSPATENK		LRLHYRRALR		NNTDPYKRAV		YCIIGRCDVT
DNQSEVADKT		EDYLWLKLNQ		VCFDDDGTSS		PQDRLTLSQF		QKQLLEDYGE
SHFTVNQQPF		LYFQVLFLTA		QFEAAVAFLF		RMERLRCHAV		HVALVLFELK
LLLKSSGQSA		QLLSHEPGDP		PCLRRLNFVR		LLMLYTRKFE		STDPREALQY
FYFLRDEKDS		QGENMFLRCV		SELVIESREF		DMILGKLEND		GSRKPGVIDK
FTSDTKPIIN		KVASVAENKG		LFEEAAKLYD		LAKNADKVLE		LMNKLLSPVV
PQISAPQSNK		ERLKNMALSI		AERYRAQGIS		ANKFVDSTFY		LLLDLITFFD
EYHSGHIDRA		FDIIERLKLV		PLNQESVEER		VAAFRNFSDE		IRHNLSEVLL
ATMNILFTQF		KRLKGTSPSS		SSRPQRVIED		RDSQLRSQAR		TLITFAGMIP
YRTSGDTNAR		LVQMEVLMN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hase M.E., Cordes V.C. (2003). Direct interaction with nup153 mediates binding of Tpr to the periphery of the nuclear pore complex. Mol. Biol. Cell. 14: 1923—1940. PMID 12802065 DOI:10.1091/mbc.E02-09-0620
• Krull S., Thyberg J., Bjorkroth B., Rackwitz H.R., Cordes V.C. (2004). Nucleoporins as components of the nuclear pore complex core structure and Tpr as the architectural element of the nuclear basket. Mol. Biol. Cell. 15: 4261—4277. PMID 15229283 DOI:10.1091/mbc.E04-03-0165
• Hawryluk-Gara L.A., Shibuya E.K., Wozniak R.W. (2005). Vertebrate Nup53 interacts with the nuclear lamina and is required for the assembly of a Nup93-containing complex. Mol. Biol. Cell. 16: 2382—2394. PMID 15703211 DOI:10.1091/mbc.E04-10-0857

Див. також

• Хромосома 16