NUP88

NUP88
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	7R5J, 7R5K, 7TDZ, 7VOP
Ідентифікатори
Символи	NUP88, nucleoporin 88, FADS4
Зовнішні ІД	OMIM: 602552 MGI: 104900 HomoloGene: 1901 GeneCards: NUP88
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transporter activity; • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • Ядерна пора; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • host cell;
Біологічний процес	• mRNA transport; • protein import into nucleus; • protein transport; • GO:0022415 viral process; • mRNA export from nucleus; • GO:0007067 мітоз; • ribosomal large subunit export from nucleus; • ribosomal small subunit export from nucleus; • nucleocytoplasmic transport; • protein export from nucleus; • regulation of glycolytic process; • tRNA export from nucleus; • protein sumoylation; • viral transcription; • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA; • GO:0046795 intracellular transport of virus; • regulation of cellular response to heat;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4927
	19069
	ENSG00000108559
	ENSMUSG00000040667
	Q99567
	Q8CEC0
	NM_002532; NM_001320653
	NM_001083331; NM_001276406; NM_172394
	NP_001307582; NP_002523
	NP_001076800; NP_001263335; NP_765982
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NUP88 (англ. Nucleoporin 88) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 741 амінокислот, а молекулярна маса — 83 542^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAEGPVGD	GELWQTWLPN	HVVFLRLREG	LKNQSPTEAE	KPASSSLPSS
PPPQLLTRNV	VFGLGGELFL	WDGEDSSFLV	VRLRGPSGGG	EEPALSQYQR
LLCINPPLFE	IYQVLLSPTQ	HHVALIGIKG	LMVLELPKRW	GKNSEFEGGK
STVNCSTTPV	AERFFTSSTS	LTLKHAAWYP	SEILDPHVVL	LTSDNVIRIY
SLREPQTPTN	VIILSEAEEE	SLVLNKGRAY	TASLGETAVA	FDFGPLAAVP
KTLFGQNGKD	EVVAYPLYIL	YENGETFLTY	ISLLHSPGNI	GKLLGPLPMH
PAAEDNYGYD	ACAVLCLPCV	PNILVIATES	GMLYHCVVLE	GEEEDDHTSE
KSWDSRIDLI	PSLYVFECVE	LELALKLASG	EDDPFDSDFS	CPVKLHRDPK
CPSRYHCTHE	AGVHSVGLTW	IHKLHKFLGS	DEEDKDSLQE	LSTEQKCFVE
HILCTKPLPC	RQPAPIRGFW	IVPDILGPTM	ICITSTYECL	IWPLLSTVHP
ASPPLLCTRE	DVEVAESPLR	VLAETPDSFE	KHIRSILQRS	VANPAFLKAS
EKDIAPPPEE	CLQLLSRATQ	VFREQYILKQ	DLAKEEIQRR	VKLLCDQKKK
QLEDLSYCRE	ERKSLREMAE	RLADKYEEAK	EKQEDIMNRM	KKLLHSFHSE
LPVLSDSERD	MKKELQLIPD	QLRHLGNAIK	QVTMKKDYQQ	QKMEKVLSLP
KPTIILSAYQ	RKCIQSILKE	EGEHIREMVK	QINDIRNHVN	F

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання. Локалізований у ядрі, комплексі ядерної пори.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240