NUP85

NUP85 (англ. Nucleoporin 85) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 656 амінокислот, а молекулярна маса — 75 019.

NUP85
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5A9Q
Ідентифікатори
Символи	NUP85, Nup75, FROUNT, nucleoporin 85, NPHS17
Зовнішні ІД	OMIM: 170285 MGI: 3046173 HomoloGene: 11755 GeneCards: NUP85
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • Ядерна мембрана • мембрана • nuclear envelope • веретено поділу • Ядерна пора • хромосома • nuclear pore outer ring • центромера • цитоскелет • кінетохор • клітинне ядро • гіалоплазма • host cell Біологічний процес • mRNA transport • protein import into nucleus • viral transcription • protein sumoylation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • хемотаксис • mitotic nuclear membrane disassembly • macrophage chemotaxis • regulation of cellular response to heat • protein transport • GO:0022415 viral process • lamellipodium assembly • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • tRNA export from nucleus • sister chromatid cohesion • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • nephron development • nucleocytoplasmic transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79902	445007
Ensembl	ENSG00000125450	ENSMUSG00000020739
UniProt	Q9BW27	Q8R480
RefSeq (мРНК)	NM_001303276 NM_024844 NM_001330472	NM_001002929
RefSeq (білок)	NP_001290205 NP_001317401 NP_079120	NP_001002929
Локус (UCSC)	Хр. 17: 75.21 – 75.24 Mb	Хр. 11: 115.46 – 115.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEELDGEPTV		TLIPGVNSKK		NQMYFDWGPG		EMLVCETSFN		KKEKSEMVPS
CPFIYIIRKD		VDVYSQILRK		LFNESHGIFL		GLQRIDEELT		GKSRKSQLVR
VSKNYRSVIR		ACMEEMHQVA		IAAKDPANGR		QFSSQVSILS		AMELIWNLCE
ILFIEVAPAG		PLLLHLLDWV		RLHVCEVDSL		SADVLGSENP		SKHDSFWNLV
TILVLQGRLD		EARQMLSKEA		DASPASAGIC		RIMGDLMRTM		PILSPGNTQT
LTELELKWQH		WHEECERYLQ		DSTFATSPHL		ESLLKIMLGD		EAALLEQKEL
LSNWYHFLVT		RLLYSNPTVK		PIDLHYYAQS		SLDLFLGGES		SPEPLDNILL
AAFEFDIHQV		IKECSIALSN		WWFVAHLTDL		LDHCKLLQSH		NLYFGSNMRE
FLLLEYASGL		FAHPSLWQLG		VDYFDYCPEL		GRVSLELHIE		RIPLNTEQKA
LKVLRICEQR		QMTEQVRSIC		KILAMKAVRN		NRLGSALSWS		IRAKDAAFAT
LVSDRFLRDY		CERGCFSDLD		LIDNLGPAMM		LSDRLTFLGK		YREFHRMYGE
KRFADAASLL		LSLMTSRIAP		RSFWMTLLTD		ALPLLEQKQV		IFSAEQTYEL
MRCLEDLTSR		RPVHGESDTE		QLQDDDIETT		KVEMLRLSLA		RNLARAIIRE
GSLEGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

• Cronshaw J.M., Krutchinsky A.N., Zhang W., Chait B.T., Matunis M.J. (2002). Proteomic analysis of the mammalian nuclear pore complex. J. Cell Biol. 158: 915—927. PMID 12196509 DOI:10.1083/jcb.200206106
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17