NUDT21

NUDT21 (англ. Nudix hydrolase 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 227 амінокислот, а молекулярна маса — 26 227.

NUDT21
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CL3, 2J8Q, 3BAP, 3BHO, 3MDG, 3MDI, 3N9U, 3P5T, 3P6Y, 3Q2S, 3Q2T
Ідентифікатори
Символи	NUDT21, CFIM25, CPSF5, nudix hydrolase 21
Зовнішні ІД	OMIM: 604978 MGI: 1915469 HomoloGene: 5090 GeneCards: NUDT21
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • histone deacetylase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • hydrolase activity • RNA binding • identical protein binding • chromatin binding • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding Клітинна компонента • paraspeckles • центросома • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • mRNA cleavage factor complex • клітинне ядро • ядерні тільця • цитоплазма • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • protein tetramerization • mRNA 3'-end processing • mRNA polyadenylation • mRNA processing • posttranscriptional regulation of gene expression • диференціація клітин • positive regulation of mRNA cleavage • protein heterotetramerization • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation • mRNA alternative polyadenylation • positive regulation of mRNA polyadenylation • messenger ribonucleoprotein complex assembly • positive regulation of stem cell differentiation • positive regulation of pro-B cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11051	68219
Ensembl	ENSG00000167005	ENSMUSG00000031754
UniProt	O43809	Q9CQF3
RefSeq (мРНК)	NM_007006	NM_026623
RefSeq (білок)	NP_008937	NP_080899
Локус (UCSC)	Хр. 16: 56.43 – 56.45 Mb	Хр. 8: 94.74 – 94.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVVPPNRSQ		TGWPRGVTQF		GNKYIQQTKP		LTLERTINLY		PLTNYTFGTK
EPLYEKDSSV		AARFQRMREE		FDKIGMRRTV		EGVLIVHEHR		LPHVLLLQLG
TTFFKLPGGE		LNPGEDEVEG		LKRLMTEILG		RQDGVLQDWV		IDDCIGNWWR
PNFEPPQYPY		IPAHITKPKE		HKKLFLVQLQ		EKALFAVPKN		YKLVAAPLFE
LYDNAPGYGP		IISSLPQLLS		RFNFIYN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Rueegsegger U., Blank D., Keller W. (1998). Human pre-mRNA cleavage factor Im is related to spliceosomal SR proteins and can be reconstituted in vitro from recombinant subunits. Mol. Cell. 1: 243—253. PMID 9659921 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80025-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rueegsegger U., Beyer K., Keller W. (1996). Purification and characterization of human cleavage factor Im involved in the 3' end processing of messenger RNA precursors. J. Biol. Chem. 271: 6107—6113. PMID 8626397 DOI:10.1074/jbc.271.11.6107
• Brown K.M., Gilmartin G.M. (2003). A mechanism for the regulation of pre-mRNA 3' processing by human cleavage factor Im. Mol. Cell. 12: 1467—1476. PMID 14690600 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00453-2
• Awasthi S., Alwine J.C. (2003). Association of polyadenylation cleavage factor I with U1 snRNP. RNA. 9: 1400—1409. PMID 14561889 DOI:10.1261/rna.5104603
• Dettwiler S., Aringhieri C., Cardinale S., Keller W., Barabino S.M. (2004). Distinct sequence motifs within the 68-kDa subunit of cleavage factor Im mediate RNA binding, protein-protein interactions, and subcellular localization. J. Biol. Chem. 279: 35788—35797. PMID 15169763 DOI:10.1074/jbc.M403927200

Див. також

• Хромосома 16