NPAS2

NPAS2 (англ. Neuronal PAS domain protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 824 амінокислот, а молекулярна маса — 91 791.

NPAS2
Ідентифікатори
Символи	NPAS2, MOP4, PASD4, bHLHe9, neuronal PAS domain protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603347 MGI: 109232 HomoloGene: 1887 GeneCards: NPAS2
Онтологія гена Молекулярна функція • Hsp90 protein binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • transcription regulator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • GO:1900404 positive regulation of DNA repair • negative regulation of cell death • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • response to redox state • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • central nervous system development • циркадний ритм • regulation of response to DNA damage stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of lipid metabolic process • positive regulation of behavioral fear response Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4862	18143
Ensembl	ENSG00000170485	ENSMUSG00000026077
UniProt	Q99743	P97460
RefSeq (мРНК)	NM_002518	NM_008719
RefSeq (білок)	NP_002509	NP_032745
Локус (UCSC)	Хр. 2: 100.82 – 101 Mb	Хр. 1: 39.23 – 39.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDEDEKDRAK		RASRNKSEKK		RRDQFNVLIK		ELSSMLPGNT		RKMDKTTVLE
KVIGFLQKHN		EVSAQTEICD		IQQDWKPSFL		SNEEFTQLML		EALDGFIIAV
TTDGSIIYVS		DSITPLLGHL		PSDVMDQNLL		NFLPEQEHSE		VYKILSSHML
VTDSPSPEYL		KSDSDLEFYC		HLLRGSLNPK		EFPTYEYIKF		VGNFRSYNNV
PSPSCNGFDN		TLSRPCRVPL		GKEVCFIATV		RLATPQFLKE		MCIVDEPLEE
FTSRHSLEWK		FLFLDHRAPP		IIGYLPFEVL		GTSGYDYYHI		DDLELLARCH
QHLMQFGKGK		SCCYRFLTKG		QQWIWLQTHY		YITYHQWNSK		PEFIVCTHSV
VSYADVRVER		RQELALEDPP		SEALHSSALK		DKGSSLEPRQ		HFNTLDVGAS
GLNTSHSPSA		SSRSSHKSSH		TAMSEPTSTP		TKLMAEASTP		ALPRSATLPQ
ELPVPGLSQA		ATMPAPLPSP		SSCDLTQQLL		PQTVLQSTPA		PMAQFSAQFS
MFQTIKDQLE		QRTRILQANI		RWQQEELHKI		QEQLCLVQDS		NVQMFLQQPA
VSLSFSSTQR		PEAQQQLQQR		SAAVTQPQLG		AGPQLPGQIS		SAQVTSQHLL
RESSVISTQG		PKPMRSSQLM		QSSGRSGSSL		VSPFSSATAA		LPPSLNLTTP
ASTSQDASQC		QPSPDFSHDR		QLRLLLSQPI		QPMMPGSCDA		RQPSEVSRTG
RQVKYAQSQT		VFQNPDAHPA		NSSSAPMPVL		LMGQAVLHPS		FPASQPSPLQ
PAQARQQPPQ		HYLQVQAPTS		LHSEQQDSLL		LSTYSQQPGT		LGYPQPPPAQ
PQPLRPPRRV		SSLSESSGLQ		QPPR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, біологічні ритми, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, ДНК, гемом. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Reick M., Garcia J.A., Dudley C., McKnight S.L. (2001). NPAS2: an analog of clock operative in the mammalian forebrain. Science. 293: 506—509. PMID 11441147 DOI:10.1126/science.1060699
• Rutter J., Reick M., Wu L.C., McKnight S.L. (2001). Regulation of clock and NPAS2 DNA binding by the redox state of NAD cofactors. Science. 293: 510—514. PMID 11441146 DOI:10.1126/science.1060698
• Hoffman A.E., Zheng T., Ba Y., Zhu Y. (2008). The circadian gene NPAS2, a putative tumor suppressor, is involved in DNA damage response. Mol. Cancer Res. 6: 1461—1468. PMID 18819933 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-07-2094
• Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 DOI:10.1152/physrev.00016.2012

Див. також

• Хромосома 2