NLGN1

NLGN1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3B3Q
Ідентифікатори
Символи	NLGN1, NL1, neuroligin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600568 MGI: 2179435 HomoloGene: 56690 GeneCards: NLGN1
Пов'язані генетичні захворювання
	періодонтит
Онтологія гена
Молекулярна функція	• PDZ domain binding; • protein dimerization activity; • cell adhesion molecule binding; • scaffold protein binding; • GO:0004091 carboxylic ester hydrolase activity; • neurexin family protein binding; • amyloid-beta binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• синапс; • integral component of membrane; • NMDA selective glutamate receptor complex; • комплекс Ґольджі; • міжклітинні контакти; • dendritic shaft; • filopodium tip; • dendritic spine; • postsynaptic membrane; • мембрана; • дендрит (нейробіологія); • excitatory synapse; • external side of plasma membrane; • cell surface; • presynapse; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • клітинна мембрана; • integral component of postsynaptic membrane; • integral component of plasma membrane; • spanning component of membrane; • postsynapse; • glutamatergic synapse; • asymmetric, glutamatergic, excitatory synapse; • integral component of postsynaptic specialization membrane;
Біологічний процес	• NMDA glutamate receptor clustering; • positive regulation of ruffle assembly; • positive regulation of synaptic vesicle exocytosis; • regulation of AMPA receptor activity; • ритмічний процес; • positive regulation of synaptic transmission, glutamatergic; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • positive regulation of circadian sleep/wake cycle, wakefulness; • regulation of respiratory gaseous exchange by nervous system process; • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • protein heterotetramerization; • synaptic vesicle transport; • terminal button organization; • synapse organization; • positive regulation of synaptic transmission, GABAergic; • postsynaptic density protein 95 clustering; • receptor localization to synapse; • protein localization to synapse; • neurexin clustering involved in presynaptic membrane assembly; • positive regulation of synaptic vesicle endocytosis; • synaptic vesicle targeting; • protein homooligomerization; • positive regulation of protein localization to synapse; • neuron projection development; • сортування білків; • GO:0010740 positive regulation of intracellular signal transduction; • довготривала потенціація; • нейробіологія розвитку; • AMPA glutamate receptor clustering; • neuronal signal transduction; • synaptic vesicle clustering; • positive regulation of synaptic vesicle clustering; • cytoskeletal matrix organization at active zone; • synapse assembly; • establishment of protein localization; • modulation of chemical synaptic transmission; • positive regulation of filopodium assembly; • адгезія клітин; • regulation of neuron differentiation; • neuron cell-cell adhesion; • positive regulation of dendritic spine development; • regulation of NMDA receptor activity; • positive regulation of excitatory postsynaptic potential; • negative regulation of dendritic spine morphogenesis; • positive regulation of synapse assembly; • excitatory synapse assembly; • positive regulation of presynaptic active zone assembly; • retrograde trans-synaptic signaling by trans-synaptic protein complex; • synaptic vesicle endocytosis; • postsynaptic membrane assembly; • presynaptic membrane assembly; • cellular response to calcium ion; • postsynaptic specialization assembly; • presynapse assembly; • regulation of presynapse organization; • synaptic membrane adhesion; • neuron projection arborization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	22871
	192167
	ENSG00000169760
	ENSMUSG00000063887
	Q8N2Q7
	Q99K10
NM_014932; NM_001365923; NM_001365924; NM_001365925; NM_001365926;
	NM_001365927; NM_001365928; NM_001365929; NM_001365930; NM_001365931; NM_001365932; NM_001365933; NM_001365934; NM_001365935; NM_001365936
	NM_001163387; NM_138666; NM_001357095; NM_001357096; NM_001357097
NP_055747; NP_001352852; NP_001352853; NP_001352854; NP_001352855;
	NP_001352856; NP_001352857; NP_001352858; NP_001352859; NP_001352860; NP_001352861; NP_001352862; NP_001352863; NP_001352864; NP_001352865
	NP_001156859; NP_619607; NP_001344024; NP_001344025; NP_001344026
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NLGN1 (англ. Neuroligin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 840 амінокислот, а молекулярна маса — 93 835^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALPRCTWPN	YVWRAVMACL	VHRGLGAPLT	LCMLGCLLQA	GHVLSQKLDD
VDPLVATNFG	KIRGIKKELN	NEILGPVIQF	LGVPYAAPPT	GERRFQPPEP
PSPWSDIRNA	TQFAPVCPQN	IIDGRLPEVM	LPVWFTNNLD	VVSSYVQDQS
EDCLYLNIYV	PTEDGPLTKK	RDEATLNPPD	TDIRDSGGPK	PVMVYIHGGS
YMEGTGNLYD	GSVLASYGNV	IVITVNYRLG	VLGFLSTGDQ	AAKGNYGLLD
LIQALRWTSE	NIGFFGGDPL	RITVFGSGAG	GSCVNLLTLS	HYSEGNRWSN
STKGLFQRAI	AQSGTALSSW	AVSFQPAKYA	RMLATKVGCN	VSDTVELVEC
LQKKPYKELV	DQDIQPARYH	IAFGPVIDGD	VIPDDPQILM	EQGEFLNYDI
MLGVNQGEGL	KFVENIVDSD	DGISASDFDF	AVSNFVDNLY	GYPEGKDVLR
ETIKFMYTDW	ADRHNPETRR	KTLLALFTDH	QWVAPAVATA	DLHSNFGSPT
YFYAFYHHCQ	TDQVPAWADA	AHGDEVPYVL	GIPMIGPTEL	FPCNFSKNDV
MLSAVVMTYW	TNFAKTGDPN	QPVPQDTKFI	HTKPNRFEEV	AWTRYSQKDQ
LYLHIGLKPR	VKEHYRANKV	NLWLELVPHL	HNLNDISQYT	STTTKVPSTD
ITFRPTRKNS	VPVTSAFPTA	KQDDPKQQPS	PFSVDQRDYS	TELSVTIAVG
ASLLFLNILA	FAALYYKKDK	RRHDVHRRCS	PQRTTTNDLT	HAQEEEIMSL
QMKHTDLDHE	CESIHPHEVV	LRTACPPDYT	LAMRRSPDDV	PLMTPNTITM
IPNTIPGIQP	LHTFNTFTGG	QNNTLPHPHP	HPHSHSTTRV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Li X., Zhang J., Cao Z., Wu J., Shi Y. (2006). Solution structure of GOPC PDZ domain and its interaction with the C-terminal motif of neuroligin. Protein Sci. 15: 2149—2158. PMID 16882988 DOI:10.1110/ps.062087506