NKD1

NKD1 (англ. Naked cuticle homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 470 амінокислот, а молекулярна маса — 52 285.

NKD1
Ідентифікатори
Символи	NKD1, Naked1, Naked cuticle 1, naked cuticle homolog 1, WNT signaling pathway inhibitor, NKD inhibitor of WNT signaling pathway 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607851 MGI: 2135954 HomoloGene: 12343 GeneCards: NKD1
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • PDZ domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • цитоплазма • клітинна мембрана • protein phosphatase type 2A complex • мембрана Біологічний процес • negative regulation of Wnt signaling pathway • positive regulation of Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • positive regulation of non-canonical Wnt signaling pathway via JNK cascade • somatic muscle development • eye photoreceptor cell differentiation • Wnt signaling pathway • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • regulation of cell migration involved in somitogenic axis elongation • negative regulation of convergent extension involved in axis elongation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	85407	93960
Ensembl	ENSG00000140807	ENSMUSG00000031661
UniProt	Q969G9	Q99MH6
RefSeq (мРНК)	NM_033119	NM_001163660 NM_027280
RefSeq (білок)	NP_149110	NP_001157132 NP_081556
Локус (UCSC)	Хр. 16: 50.55 – 50.65 Mb	Хр. 8: 89.25 – 89.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKLHSKPAA		VCKRRESPEG		DSFAVSAAWA		RKGIEEWIGR		QRCPGGVSGP
RQLRLAGTIG		RSTRELVGDV		LRDTLSEEEE		DDFRLEVALP		PEKTDGLGSG
DEKKMERVSE		PCPGSKKQLK		FEELQCDVSM		EEDSRQEWTF		TLYDFDNNGK
VTREDITSLL		HTIYEVVDSS		VNHSPTSSKM		LRVKLTVAPD		GSQSKRSVLV
NQADLQSARP		RAETKPTEDL		RSWEKKQRAP		LRFQGDSRLE		QSGCYHHCVD
ENIERRNHYL		DLAGIENYTS		QFGPGSPSVA		QKSELPPRTS		NPTRSRSHEP
EAIHIPHRKP		QGVDPASFHF		LDTPIAKVSE		LQQRLRGTQD		GSKHFVRSPK
AQGKSVGVGH		VARGARNKPP		LGPAIPAVSP		SAHLAASPAL		LPSLAPLGHK
KHKHRAKESQ		QGCRGLQAPL		ASGGPVLGRE		HLRELPALVV		YESQAGQPVQ
RHEHHHHHEH		HHHYHHFYQT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як сигнальний шлях Wnt. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Wharton K.A. Jr., Zimmermann G., Rousset R., Scott M.P. (2001). Vertebrate proteins related to Drosophila Naked Cuticle bind Dishevelled and antagonize Wnt signaling. Dev. Biol. 234: 93—106. PMID 11356022 DOI:10.1006/dbio.2001.0238
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Katoh M. (2001). Molecular cloning, gene structure, and expression analyses of NKD1 and NKD2. Int. J. Oncol. 19: 963—969. PMID 11604995

Див. також

• Хромосома 16