NEK1

NEK1 (англ. NIMA related kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 258 амінокислот, а молекулярна маса — 142 828.

NEK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4APC, 4B9D
Ідентифікатори
Символи	NEK1, NY-REN-55, SRPS2, SRPS2A, SRTD6, NIMA related kinase 1, ALS24
Зовнішні ІД	OMIM: 604588 MGI: 97303 HomoloGene: 14376 GeneCards: NEK1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • зв'язування з іоном металу • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • protein serine/threonine kinase activity • 14-3-3 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • центросома • pericentriolar material • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • клітинне ядро Біологічний процес • фосфорилювання • поділ клітини • protein phosphorylation • cell projection organization • клітинний цикл • peptidyl-tyrosine phosphorylation • cilium assembly • regulation of mitotic cell cycle • GO:0072468 сигнальна трансдукція • stress-activated protein kinase signaling cascade • activation of protein kinase activity • regulation of apoptotic process • cellular response to DNA damage stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4750	18004
Ensembl	ENSG00000137601	ENSMUSG00000031644
UniProt	Q96PY6	P51954
RefSeq (мРНК)	NM_001199397 NM_001199398 NM_001199399 NM_001199400 NM_012224 NM_001374418 NM_001374419 NM_001374420 NM_001374421 NM_001374422 NM_001374423	NM_001293637 NM_001293638 NM_001293639 NM_175089
RefSeq (білок)	NP_001186326 NP_001186327 NP_001186328 NP_001186329 NP_036356 NP_001361347 NP_001361348 NP_001361349 NP_001361350 NP_001361351 NP_001361352	NP_001280566 NP_001280567 NP_001280568 NP_780298
Локус (UCSC)	Хр. 4: 169.37 – 169.61 Mb	Хр. 8: 61.45 – 61.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEKYVRLQKI		GEGSFGKAIL		VKSTEDGRQY		VIKEINISRM		SSKEREESRR
EVAVLANMKH		PNIVQYRESF		EENGSLYIVM		DYCEGGDLFK		RINAQKGVLF
QEDQILDWFV		QICLALKHVH		DRKILHRDIK		SQNIFLTKDG		TVQLGDFGIA
RVLNSTVELA		RTCIGTPYYL		SPEICENKPY		NNKSDIWALG		CVLYELCTLK
HAFEAGSMKN		LVLKIISGSF		PPVSLHYSYD		LRSLVSQLFK		RNPRDRPSVN
SILEKGFIAK		RIEKFLSPQL		IAEEFCLKTF		SKFGSQPIPA		KRPASGQNSI
SVMPAQKITK		PAAKYGIPLA		YKKYGDKKLH		EKKPLQKHKQ		AHQTPEKRVN
TGEERRKISE		EAARKRRLEF		IEKEKKQKDQ		IISLMKAEQM		KRQEKERLER
INRAREQGWR		NVLSAGGSGE		VKAPFLGSGG		TIAPSSFSSR		GQYEHYHAIF
DQMQQQRAED		NEAKWKREIY		GRGLPERGIL		PGVRPGFPYG		AAGHHHFPDA
DDIRKTLKRL		KAVSKQANAN		RQKGQLAVER		AKQVEEFLQR		KREAMQNKAR
AEGHMVYLAR		LRQIRLQNFN		ERQQIKAKLR		GEKKEANHSE		GQEGSEEADM
RRKKIESLKA		HANARAAVLK		EQLERKRKEA		YEREKKVWEE		HLVAKGVKSS
DVSPPLGQHE		TGGSPSKQQM		RSVISVTSAL		KEVGVDSSLT		DTRETSEEMQ
KTNNAISSKR		EILRRLNENL		KAQEDEKGKQ		NLSDTFEINV		HEDAKEHEKE
KSVSSDRKKW		EAGGQLVIPL		DELTLDTSFS		TTERHTVGEV		IKLGPNGSPR
RAWGKSPTDS		VLKILGEAEL		QLQTELLENT		TIRSEISPEG		EKYKPLITGE
KKVQCISHEI		NPSAIVDSPV		ETKSPEFSEA		SPQMSLKLEG		NLEEPDDLET
EILQEPSGTN		KDESLPCTIT		DVWISEEKET		KETQSADRIT		IQENEVSEDG
VSSTVDQLSD		IHIEPGTNDS		QHSKCDVDKS		VQPEPFFHKV		VHSEHLNLVP
QVQSVQCSPE		ESFAFRSHSH		LPPKNKNKNS		LLIGLSTGLF		DANNPKMLRT
CSLPDLSKLF		RTLMDVPTVG		DVRQDNLEID		EIEDENIKEG		PSDSEDIVFE
ETDTDLQELQ		ASMEQLLREQ		PGEEYSEEEE		SVLKNSDVEP		TANGTDVADE
DDNPSSESAL		NEEWHSDNSD		GEIASECECD		SVFNHLEELR		LHLEQEMGFE
KFFEVYEKIK		AIHEDEDENI		EICSKIVQNI		LGNEHQHLYA		KILHLVMADG
AYQEDNDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, біогенез та деградація війок, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chen Y., Gaczynska M., Osmulski P., Polci R., Riley D.J. (2010). Phosphorylation by Nek1 regulates opening and closing of voltage dependent anion channel 1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 394: 798—803. PMID 20230784 DOI:10.1016/j.bbrc.2010.03.077

Див. також

• Хромосома 4