NEIL3

NEIL3 (англ. Nei like DNA glycosylase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 605 амінокислот, а молекулярна маса — 67 769.

NEIL3
Ідентифікатори
Символи	NEIL3, FGP2, FPG2, NEI3, ZGRF3, hFPG2, hNEI3, nei like DNA glycosylase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 608934 MGI: 2384588 HomoloGene: 10094 GeneCards: NEIL3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • zinc ion binding • hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds • damaged DNA binding • каталітична активність • lyase activity • nucleic acid binding • hydrolase activity • DNA N-glycosylase activity • bubble DNA binding • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • single-stranded DNA binding • double-stranded DNA binding • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • nucleotide-excision repair • cellular response to DNA damage stimulus • обмін речовин • GO:0100026 Репарація ДНК • base-excision repair Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55247	234258
Ensembl	ENSG00000109674	ENSMUSG00000039396
UniProt	Q8TAT5	Q8K203
RefSeq (мРНК)	NM_018248	NM_146208
RefSeq (білок)	NP_060718	NP_666320
Локус (UCSC)	Хр. 4: 177.31 – 177.36 Mb	Хр. 8: 54.04 – 54.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVEGPGCTLN		GEKIRARVLP		GQAVTGVRGS		ALRSLQGRAL		RLAASTVVVS
PQAAALNNDS		SQNVLSLFNG		YVYSGVETLG		KELFMYFGPK		ALRIHFGMKG
FIMINPLEYK		YKNGASPVLE		VQLTKDLICF		FDSSVELRNS		MESQQRIRMM
KELDVCSPEF		SFLRAESEVK		KQKGRMLGDV		LMDQNVLPGV		GNIIKNEALF
DSGLHPAVKV		CQLTDEQIHH		LMKMIRDFSI		LFYRCRKAGL		ALSKHYKVYK
RPNCGQCHCR		ITVCRFGDNN		RMTYFCPHCQ		KENPQHVDIC		KLPTRNTIIS
WTSSRVDHVM		DSVARKSEEH		WTCVVCTLIN		KPSSKACDAC		LTSRPIDSVL
KSEENSTVFS		HLMKYPCNTF		GKPHTEVKIN		RKTAFGTTTL		VLTDFSNKSS
TLERKTKQNQ		ILDEEFQNSP		PASVCLNDIQ		HPSKKTTNDI		TQPSSKVNIS
PTISSESKLF		SPAHKKPKTA		QYSSPELKSC		NPGYSNSELQ		INMTDGPRTL
NPDSPRCSKH		NRLCILRVVG		KDGENKGRQF		YACPLPREAQ		CGFFEWADLS
FPFCNHGKRS		TMKTVLKIGP		NNGKNFFVCP		LGKEKQCNFF		QWAENGPGIK
IIPGC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, глікозидаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Torisu K., Tsuchimoto D., Ohnishi Y., Nakabeppu Y. (2005). Hematopoietic tissue-specific expression of mouse Neil3 for endonuclease VIII-like protein. J. Biochem. 138: 763—772. PMID 16428305 DOI:10.1093/jb/mvi168
• Krokeide S.Z., Bolstad N., Laerdahl J.K., Bjoras M., Luna L. (2009). Expression and purification of NEIL3, a human DNA glycosylase homolog. Protein Expr. Purif. 65: 160—164. PMID 19121397 DOI:10.1016/j.pep.2008.11.014
• Neurauter C.G., Luna L., Bjoras M. (2012). Release from quiescence stimulates the expression of human NEIL3 under the control of the Ras dependent ERK-MAP kinase pathway. DNA Repair. 11: 401—409. PMID 22365498 DOI:10.1016/j.dnarep.2012.01.007

Див. також

• Хромосома 4