NDRG1

NDRG1
Ідентифікатори
Символи	NDRG1, CAP43, CMT4D, DRG-1, DRG1, GC4, HMSNL, NDR1, NMSL, PROXY1, RIT42, RTP, TARG1, TDD5, N-myc downstream regulated 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605262 MGI: 1341799 HomoloGene: 55953 GeneCards: NDRG1
Пов'язані генетичні захворювання
	посттравматичний стресовий розлад, Charcot-Marie-Tooth disease type 4D
Онтологія гена
Молекулярна функція	• microtubule binding; • cadherin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • gamma-tubulin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • центросома; • мембрана; • microtubule cytoskeleton; • myelin sheath; • клітинна мембрана; • центр організації мікротрубочок; • recycling endosome membrane; • perinuclear region of cytoplasm; • мікротрубочка; • екзосома; • цитоскелет; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• mast cell activation; • peripheral nervous system myelin maintenance; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • response to metal ion; • positive regulation of spindle checkpoint; • regulation of cell population proliferation; • cellular response to hypoxia; • negative regulation of cell population proliferation; • regulation of apoptotic process; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • postsynapse organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10397
	17988
	ENSG00000104419
	ENSMUSG00000005125
	Q92597
	Q62433
NM_001135242; NM_001258432; NM_001258433; NM_006096; NM_001374844;
	NM_001374845; NM_001374846; NM_001374847
	NM_008681
NP_001128714; NP_001245361; NP_001245362; NP_006087; NP_001361773;
	NP_001361774; NP_001361775; NP_001361776
	NP_032707
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NDRG1 (англ. N-myc downstream regulated 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 394 амінокислот, а молекулярна маса — 42 835^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSREMQDVDL	AEVKPLVEKG	ETITGLLQEF	DVQEQDIETL	HGSVHVTLCG
TPKGNRPVIL	TYHDIGMNHK	TCYNPLFNYE	DMQEITQHFA	VCHVDAPGQQ
DGAASFPAGY	MYPSMDQLAE	MLPGVLQQFG	LKSIIGMGTG	AGAYILTRFA
LNNPEMVEGL	VLINVNPCAE	GWMDWAASKI	SGWTQALPDM	VVSHLFGKEE
MQSNVEVVHT	YRQHIVNDMN	PGNLHLFINA	YNSRRDLEIE	RPMPGTHTVT
LQCPALLVVG	DSSPAVDAVV	ECNSKLDPTK	TTLLKMADCG	GLPQISQPAK
LAEAFKYFVQ	GMGYMPSASM	TRLMRSRTAS	GSSVTSLDGT	RSRSHTSEGT
RSRSHTSEGT	RSRSHTSEGA	HLDITPNSGA	AGNSAGPKSM	EVSC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані.

Література

Kokame K., Kato H., Miyata T. (1996). Homocysteine-respondent genes in vascular endothelial cells identified by differential display analysis. GRP78/BiP and novel genes. J. Biol. Chem. 271: 29659—29665. PMID 8939898 DOI:10.1074/jbc.271.47.29659
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Agarwala K.L., Kokame K., Kato H., Miyata T. (2000). Phosphorylation of RTP, an ER stress-responsive cytoplasmic protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 272: 641—647. PMID 10860807 DOI:10.1006/bbrc.2000.2833
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
McCaig C., Potter L., Abramczyk O., Murray J.T. (2011). Phosphorylation of NDRG1 is temporally and spatially controlled during the cell cycle. Biochem. Biophys. Res. Commun. 411: 227—234. PMID 21708134 DOI:10.1016/j.bbrc.2011.06.092