NCBP1

NCBP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1H2T, 1H2U, 1H2V, 1H6K, 1N52, 1N54, 3FEX, 3FEY
Ідентифікатори
Символи	NCBP1, CBP80, NCBP, Sto1, nuclear cap binding protein subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600469 MGI: 1891840 HomoloGene: 1859 GeneCards: NCBP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • mRNA binding; • RNA cap binding; • RNA 7-methylguanosine cap binding;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • mRNA cap binding complex; • мітохондрія; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • nuclear cap binding complex; • RNA cap binding complex; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA transport; • positive regulation of mRNA 3'-end processing; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • mRNA processing; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription by RNA polymerase II; • mRNA export from nucleus; • regulation of mRNA polyadenylation; • positive regulation of cell growth; • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation; • Сплайсинг РНК; • mRNA cis splicing, via spliceosome; • Сайленсинг генів; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; • mRNA 3'-end processing; • histone mRNA metabolic process; • regulation of translation; • regulation of translational initiation; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • RNA export from nucleus; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • nuclear export; • GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing; • spliceosomal complex assembly; • mRNA splicing, via spliceosome; • RNA metabolic process; • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • positive regulation of RNA binding; • GO:0015915 транспорт; • regulation of mRNA processing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	4686
	433702
	ENSG00000136937
	ENSMUSG00000028330
	Q09161
	Q3UYV9
	NM_002486; NM_001351504; NM_001351505; NM_001351506; NM_001351507
	NM_001033201
	NP_002477; NP_001338433; NP_001338434; NP_001338435; NP_001338436
	NP_001028373
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NCBP1 (англ. Nuclear cap binding protein subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 790 амінокислот, а молекулярна маса — 91 839^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRRRHSDEN	DGGQPHKRRK	TSDANETEDH	LESLICKVGE	KSACSLESNL
EGLAGVLEAD	LPNYKSKILR	LLCTVARLLP	EKLTIYTTLV	GLLNARNYNF
GGEFVEAMIR	QLKESLKANN	YNEAVYLVRF	LSDLVNCHVI	AAPSMVAMFE
NFVSVTQEED	VPQVRRDWYV	YAFLSSLPWV	GKELYEKKDA	EMDRIFANTE
SYLKRRQKTH	VPMLQVWTAD	KPHPQEEYLD	CLWAQIQKLK	KDRWQERHIL
RPYLAFDSIL	CEALQHNLPP	FTPPPHTEDS	VYPMPRVIFR	MFDYTDDPEG
PVMPGSHSVE	RFVIEENLHC	IIKSHWKERK	TCAAQLVSYP	GKNKIPLNYH
IVEVIFAELF	QLPAPPHIDV	MYTTLLIELC	KLQPGSLPQV	LAQATEMLYM
RLDTMNTTCV	DRFINWFSHH	LSNFQFRWSW	EDWSDCLSQD	PESPKPKFVR
EVLEKCMRLS	YHQRILDIVP	PTFSALCPAN	PTCIYKYGDE	SSNSLPGHSV
ALCLAVAFKS	KATNDEIFSI	LKDVPNPNQD	DDDDEGFSFN	PLKIEVFVQT
LLHLAAKSFS	HSFSALAKFH	EVFKTLAESD	EGKLHVLRVM	FEVWRNHPQM
IAVLVDKMIR	TQIVDCAAVA	NWIFSSELSR	DFTRLFVWEI	LHSTIRKMNK
HVLKIQKELE	EAKEKLARQH	KRRSDDDDRS	SDRKDGVLEE	QIERLQEKVE
SAQSEQKNLF	LVIFQRFIMI	LTEHLVRCET	DGTSVLTPWY	KNCIERLQQI
FLQHHQIIQQ	YMVTLENLLF	TAELDPHILA	VFQQFCALQA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транспорт, транспорт мРНК, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Kataoka N., Ohno M., Kangawa K., Tokoro Y., Shimura Y. (1994). Cloning of a complementary DNA encoding an 80 kilodalton nuclear cap binding protein. Nucleic Acids Res. 22: 3861—3865. PMID 7937105 DOI:10.1093/nar/22.19.3861
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gamberi C., Izaurralde E., Beisel C., Mattaj I.W. (1997). Interaction between the human nuclear cap-binding protein complex and hnRNP F. Mol. Cell. Biol. 17: 2587—2597. PMID 9111328 DOI:10.1128/MCB.17.5.2587
Wilson K.F., Wu W.J., Cerione R.A. (2000). Cdc42 stimulates RNA splicing via the S6 kinase and a novel S6 kinase target, the nuclear cap-binding complex. J. Biol. Chem. 275: 37307—37310. PMID 10973943 DOI:10.1074/jbc.C000482200
Ishigaki Y., Li X., Serin G., Maquat L.E. (2001). Evidence for a pioneer round of mRNA translation: mRNAs subject to nonsense-mediated decay in mammalian cells are bound by CBP80 and CBP20. Cell. 106: 607—617. PMID 11551508 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00475-5
McKendrick L., Thompson E., Ferreira J., Morley S.J., Lewis J.D. (2001). Interaction of eukaryotic translation initiation factor 4G with the nuclear cap-binding complex provides a link between nuclear and cytoplasmic functions of the m(7) guanosine cap. Mol. Cell. Biol. 21: 3632—3641. PMID 11340157 DOI:10.1128/MCB.21.11.3632-3641.2001

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7658 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q09161 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7658 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q09161 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]