NBR1

NBR1 (англ. NBR1, autophagy cargo receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 966 амінокислот, а молекулярна маса — 107 413.

NBR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WJ6, 2BKF, 2CP8, 2G4S, 2L8J, 2MGW, 2MJ5, 4OLE
Ідентифікатори
Символи	NBR1, 1A1-3B, IAI3B, M17S2, MIG19, neighbor of BRCA1 gene 1, autophagy cargo receptor, NBR1 autophagy cargo receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 166945 MGI: 108498 HomoloGene: 7438 GeneCards: NBR1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mitogen-activated protein kinase binding • ubiquitin binding Клітинна компонента • цитоплазма • M band • autophagosome • гіалоплазма • late endosome • лізосома • екзосома • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • phagophore assembly site • мітохондрія • нуклеоплазма • ядерні тільця • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • protein complex oligomerization • negative regulation of osteoblast differentiation • regulation of stress-activated MAPK cascade • regulation of bone mineralization • macroautophagy Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4077	17966
Ensembl	ENSG00000188554	ENSMUSG00000017119
UniProt	Q14596	P97432
RefSeq (мРНК)	NM_001291571 NM_001291572 NM_005899 NM_031858 NM_031862	NM_001252220 NM_001252222 NM_001252223 NM_008676
RefSeq (білок)	NP_001278500 NP_001278501 NP_005890 NP_114068	NP_001239149 NP_001239151 NP_001239152 NP_032702
Локус (UCSC)	Хр. 17: 43.17 – 43.21 Mb	Хр. 11: 101.44 – 101.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPQVTLNVT		FKNEIQSFLV		SDPENTTWAD		IEAMVKVSFD		LNTIQIKYLD
EENEEVSINS		QGEYEEALKM		AVKQGNQLQM		QVHEGHHVVD		EAPPPVVGAK
RLAARAGKKP		LAHYSSLVRV		LGSDMKTPED		PAVQSFPLVP		CDTDQPQDKP
PDWFTSYLET		FREQVVNETV		EKLEQKLHEK		LVLQNPSLGS		CPSEVSMPTS
EETLFLPENQ		FSWHIACNNC		QRRIVGVRYQ		CSLCPSYNIC		EDCEAGPYGH
DTNHVLLKLR		RPVVGSSEPF		CHSKYSTPRL		PAALEQVRLQ		KQVDKNFLKA
EKQRLRAEKK		QRKAEVKELK		KQLKLHRKIH		LWNSIHGLQS		PKSPLGRPES
LLQSNTLMLP		LQPCTSVMPM		LSAAFVDENL		PDGTHLQPGT		KFIKHWRMKN
TGNVKWSADT		KLKFMWGNLT		LASTEKKDVL		VPCLKAGHVG		VVSVEFIAPA
LEGTYTSHWR		LSHKGQQFGP		RVWCSIIVDP		FPSEESPDNI		EKGMISSSKT
DDLTCQQEET		FLLAKEERQL		GEVTEQTEGT		AACIPQKAKN		VASERELYIP
SVDLLTAQDL		LSFELLDINI		VQELERVPHN		TPVDVTPCMS		PLPHDSPLIE
KPGLGQIEEE		NEGAGFKALP		DSMVSVKRKA		ENIASVEEAE		EDLSGTQFVC
ETVIRSLTLD		AAPDHNPPCR		QKSLQMTFAL		PEGPLGNEKE		EIIHIAEEEA
VMEEEEDEED		EEEEDELKDE		VQSQSSASSE		DYIIILPECF		DTSRPLGDSM
YSSALSQPGL		ERGAEGKPGV		EAGQEPAEAG		ERLPGGENQP		QEHSISDILT
TSQTLETVPL		IPEVVELPPS		LPRSSPCVHH		HGSPGVDLPV		TIPEVSSVPD
QIRGEPRGSS		GLVNSRQKSY		DHSRHHHGSS		IAGGLVKGAL		SVAASAYKAL
FAGPPVTAQP		IISEDQTAAL		MAHLFEMGFC		DRQLNLRLLK		KHNYNILQVV
TELLQLNNND		WYSQRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоплазматичних везикулах, лізосомі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dimitrov S., Brennerova M., Forejt J. (2001). Expression profiles and intergenic structure of head-to-head oriented Brca1 and Nbr1 genes. Gene. 262: 89—98. PMID 11179671 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00549-7
• Waters S., Marchbank K., Solomon E., Whitehouse C., Gautel M. (2009). Interactions with LC3 and polyubiquitin chains link nbr1 to autophagic protein turnover. FEBS Lett. 583: 1846—1852. PMID 19427866 DOI:10.1016/j.febslet.2009.04.049
• Mueller S., Kursula I., Zou P., Wilmanns M. (2006). Crystal structure of the PB1 domain of NBR1. FEBS Lett. 580: 341—344. PMID 16376336 DOI:10.1016/j.febslet.2005.12.021

Див. також

• Хромосома 17