MTDH

MTDH (англ. Metadherin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 582 амінокислот, а молекулярна маса — 63 837.

MTDH
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4QMG
Ідентифікатори
Символи	MTDH, 3D3, AEG-1, AEG1, LYRIC, LYRIC/3D3, metadherin
Зовнішні ІД	OMIM: 610323 MGI: 1914404 HomoloGene: 12089 GeneCards: MTDH
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • NF-kappaB binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded RNA binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • Ядерні тільця • Ядерна мембрана • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • bicellular tight junction • intercellular canaliculus • Міжклітинні контакти • apical plasma membrane • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • fibrillar center • ядерце Біологічний процес • positive regulation of protein kinase B signaling • positive regulation of autophagy • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • bicellular tight junction assembly • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	92140	67154
Ensembl	ENSG00000147649	ENSMUSG00000022255
UniProt	Q86UE4	Q80WJ7
RefSeq (мРНК)	NM_178812 NM_001363136 NM_001363137 NM_001363138 NM_001363139	NM_026002 NM_001357925 NM_001357926
RefSeq (білок)	NP_848927 NP_001350065 NP_001350066 NP_001350067 NP_001350068	NP_080278 NP_001344854 NP_001344855
Локус (UCSC)	Хр. 8: 97.64 – 97.73 Mb	Хр. 15: 34.08 – 34.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAARSWQDEL		AQQAEEGSAR		LREMLSVGLG		FLRTELGLDL		GLEPKRYPGW
VILVGTGALG		LLLLFLLGYG		WAAACAGARK		KRRSPPRKRE		EAAAVPAAAP
DDLALLKNLR		SEEQKKKNRK		KLSEKPKPNG		RTVEVAEGEA		VRTPQSVTAK
QPPEIDKKNE		KSKKNKKKSK		SDAKAVQNSS		RHDGKEVDEG		AWETKISHRE
KRQQRKRDKV		LTDSGSLDST		IPGIENTITV		TTEQLTTASF		PVGSKKNKGD
SHLNVQVSNF		KSGKGDSTLQ		VSSGLNENLT		VNGGGWNEKS		VKLSSQISAG
EEKWNSVSPA		SAGKRKTEPS		AWSQDTGDAN		TNGKDWGRSW		SDRSIFSGIG
STAEPVSQST		TSDYQWDVSR		NQPYIDDEWS		GLNGLSSADP		NSDWNAPAEE
WGNWVDEERA		SLLKSQEPIP		DDQKVSDDDK		EKGEGALPTG		KSKKKKKKKK
KQGEDNSTAQ		DTEELEKEIR		EDLPVNTSKT		RPKQEKAFSL		KTISTSDPAE
VLVKNSQPIK		TLPPATSTEP		SVILSKSDSD		KSSSQVPPIL		QETDKSKSNT
KQNSVPPSQT		KSETSWESPK		QIKKKKKARR		ET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, щільних контактах.

Література

• Sutherland H.G.E., Lam Y.W., Briers S., Lamond A.I., Bickmore W.A. (2004). 3D3/lyric: a novel transmembrane protein of the endoplasmic reticulum and nuclear envelope, which is also present in the nucleolus. Exp. Cell Res. 294: 94—105. PMID 14980505 DOI:10.1016/j.yexcr.2003.11.020
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Brown D.M., Ruoslahti E. (2004). Metadherin, a cell surface protein in breast tumors that mediates lung metastasis. Cancer Cell. 5: 365—374. PMID 15093543 DOI:10.1016/S1535-6108(04)00079-0
• Ash S.C., Yang D.Q., Britt D.E. (2008). LYRIC/AEG-1 overexpression modulates BCCIPalpha protein levels in prostate tumor cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 371: 333—338. PMID 18440304 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.04.084

Див. також

• Хромосома 8