MRNIP

MRNIP (англ. MRN complex interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 343 амінокислот, а молекулярна маса — 37 743.

MRNIP
Ідентифікатори
Символи	MRNIP, C5orf45, MRN complex interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 617154 MGI: 1915317 HomoloGene: 75241 GeneCards: MRNIP
Онтологія гена Молекулярна функція • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • Mre11 complex Біологічний процес • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling • response to ionizing radiation • positive regulation of protein kinase activity • protein localization to chromatin • positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination • regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51149	68067
Ensembl	ENSG00000161010 ENSG00000283918	ENSMUSG00000020381
UniProt	Q6NTE8	Q9D1F5
RefSeq (мРНК)	NM_016175 NM_001017987 NM_001018061 NM_001018062	NM_026543
RefSeq (білок)	NP_001017987 NP_057259	NP_080819
Локус (UCSC)	Хр. 5: 179.84 – 179.86 Mb	Хр. 11: 50.07 – 50.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASLQRSRVL		RCCSCRLFQA		HQVKKSVKWT		CKACGEKQSF		LQAYGEGSGA
DCRRHVQKLN		LLQGQVSELP		LRSLEETVSA		SEEENVGHQQ		AGNVKQQEKS
QPSESRWLKY		LEKDSQELEL		EGTGVCFSKQ		PSSKMEEPGP		RFSQDLPRKR
KWSRSTVQPP		CSRGVQDSGG		SEVAWGPQKG		QAGLTWKVKQ		GSSPCLQENS
ADCSAGELRG		PGKELWSPIQ		QVTATSSKWA		QFVLPPRKSS		HVDSEQPRSL
QRDPRPAGPA		QAKQGTPRAQ		ASREGLSRPT		AAVQLPRATH		PVTSGSERPC
GKTSWDARTP		WAEGGPLVLE		AQNPRPTRLC		DLFITGEDFD		DDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5