MICAL1

MICAL1 (англ. Microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 067 амінокислот, а молекулярна маса — 117 875.

MICAL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WYL, 2CO8
Ідентифікатори
Символи	MICAL1, MICAL, MICAL-1, NICAL, microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607129 MGI: 2385847 HomoloGene: 11246 GeneCards: MICAL1
Онтологія гена Молекулярна функція • SH3 domain binding • oxidoreductase activity • actin binding • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen • FAD binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • protein kinase binding • monooxygenase activity • NAD(P)H oxidase H2O2-forming activity • actin filament binding Клітинна компонента • цитоплазма • цитоскелет • Проміжні філаменти • hippocampal mossy fiber expansion • гіалоплазма • midbody • intercellular bridge • клітинна мембрана • actin cytoskeleton Біологічний процес • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • actin filament depolymerization • sulfur oxidation • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • negative regulation of apoptotic process • cytoskeleton organization • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of regulated secretory pathway • зсідання крові Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64780	171580
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000019823
UniProt	Q8TDZ2	Q8VDP3
RefSeq (мРНК)	NM_022765 NM_001159291 NM_001286613	NM_001164433 NM_138315 NM_001358838 NM_001358839
RefSeq (білок)	NP_001152763 NP_001273542 NP_073602	NP_001157905 NP_612188 NP_001345767 NP_001345768
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 10: 41.35 – 41.36 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASPTSTNPA		HAHFESFLQA		QLCQDVLSSF		QELCGALGLE		PGGGLPQYHK
IKDQLNYWSA		KSLWTKLDKR		AGQPVYQQGR		ACTSTKCLVV		GAGPCGLRVA
VELALLGARV		VLVEKRTKFS		RHNVLHLWPF		TIHDLRALGA		KKFYGRFCTG
TLDHISIRQL		QLLLLKVALL		LGVEIHWGVT		FTGLQPPPRK		GSGWRAQLQP
NPPAQLANYE		FDVLISAAGG		KFVPEGFKVR		EMRGKLAIGI		TANFVNGRTV
EETQVPEISG		VARIYNQSFF		QSLLKATGID		LENIVYYKDD		THYFVMTAKK
QCLLRLGVLR		QDWPDTNRLL		GSANVVPEAL		QRFTRAAADF		ATHGKLGKLE
FAQDAHGQPD		VSAFDFTSMM		RAESSARVQE		KHGARLLLGL		VGDCLVEPFW
PLGTGVARGF		LAAFDAAWMV		KRWAEGAESL		EVLAERESLY		QLLSQTSPEN
MHRNVAQYGL		DPATRYPNLN		LRAVTPNQVR		DLYDVLAKEP		VQRNNDKTDT
GMPATGSAGT		QEELLRWCQE		QTAGYPGVHV		SDLSSSWADG		LALCALVYRL
QPGLLEPSEL		QGLGALEATA		WALKVAENEL		GITPVVSAQA		VVAGSDPLGL
IAYLSHFHSA		FKSMAHSPGP		VSQASPGTSS		AVLFLSKLQR		TLQRSRAKEN
AEDAGGKKLR		LEMEAETPST		EVPPDPEPGV		PLTPPSQHQE		AGAGDLCALC
GEHLYVLERL		CVNGHFFHRS		CFRCHTCEAT		LWPGGYEQHP		GDGHFYCLQH
LPQTDHKAEG		SDRGPESPEL		PTPSENSMPP		GLSTPTASQE		GAGPVPDPSQ
PTRRQIRLSS		PERQRLSSLN		LTPDPEMEPP		PKPPRSCSAL		ARHALESSFV
GWGLPVQSPQ		ALVAMEKEEK		ESPFSSEEEE		EDVPLDSDVE		QALQTFAKTS
GTMNNYPTWR		RTLLRRAKEE		EMKRFCKAQT		IQRRLNEIEA		ALRELEAEGV
KLELALRRQS		SSPEQQKKLW		VGQLLQLVDK		KNSLVAEEAE		LMITVQELNL
EEKQWQLDQE		LRGYMNREEN		LKTAADRQAE		DQVLRKLVDL		VNQRDALIRF
QEERRLSELA		LGTGAQG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку, НАДФ, ФАД, флавопротеїном. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Terman J.R., Mao T., Pasterkamp R.J., Yu H.-H., Kolodkin A.L. (2002). MICALs, a family of conserved flavoprotein oxidoreductases, function in plexin-mediated axonal repulsion. Cell. 109: 887—900. PMID 12110185 DOI:10.1016/S0092-8674(02)00794-8
• Weide T., Teuber J., Bayer M., Barnekow A. (2003). MICAL-1 isoforms, novel rab1 interacting proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306: 79—86. PMID 12788069 DOI:10.1016/S0006-291X(03)00918-5
• Fischer J., Weide T., Barnekow A. (2005). The MICAL proteins and rab1: a possible link to the cytoskeleton?. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328: 415—423. PMID 15694364 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.12.182
• Schmidt E.F., Shim S.O., Strittmatter S.M. (2008). Release of MICAL autoinhibition by semaphorin-plexin signaling promotes interaction with collapsin response mediator protein. J. Neurosci. 28: 2287—2297. PMID 18305261 DOI:10.1523/JNEUROSCI.5646-07.2008
• Zucchini D., Caprini G., Pasterkamp R.J., Tedeschi G., Vanoni M.A. (2011). Kinetic and spectroscopic characterization of the putative monooxygenase domain of human MICAL-1. Arch. Biochem. Biophys. 515: 1—13. PMID 21864500 DOI:10.1016/j.abb.2011.08.004

Див. також

• Хромосома 6