MED6

MED6 (англ. Mediator complex subunit 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 246 амінокислот, а молекулярна маса — 28 425.

MED6
Ідентифікатори
Символи	MED6, ARC33, NY-REN-28, mediator complex subunit 6
Зовнішні ІД	OMIM: 602984 MGI: 1917042 HomoloGene: 3990 GeneCards: MED6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • mediator complex • core mediator complex • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10001	69792
Ensembl	ENSG00000133997	ENSMUSG00000002679
UniProt	O75586	Q921D4
RefSeq (мРНК)	NM_005466 NM_001284209 NM_001284210 NM_001284211	NM_027213 NM_001347384 NM_001347385 NM_001347386
RefSeq (білок)	NP_001271138 NP_001271139 NP_001271140 NP_005457	NP_001334313 NP_001334314 NP_001334315
Локус (UCSC)	Хр. 14: 70.58 – 70.6 Mb	Хр. 12: 81.62 – 81.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVDIRDNL		LGISWVDSSW		IPILNSGSVL		DYFSERSNPF		YDRTCNNEVV
KMQRLTLEHL		NQMVGIEYIL		LHAQEPILFI		IRKQQRQSPA		QVIPLADYYI
IAGVIYQAPD		LGSVINSRVL		TAVHGIQSAF		DEAMSYCRYH		PSKGYWWHFK
DHEEQDKVRP		KAKRKEEPSS		IFQRQRVDAL		LLDLRQKFPP		KFVQLKPGEK
PVPVDQTKKE		AEPIPETVKP		EEKETTKNVQ		QTVSAKGPPE		KRMRLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Akoulitchev S., Chuikov S., Reinberg D. (2000). TFIIH is negatively regulated by cdk8-containing mediator complexes. Nature. 407: 102—106. PMID 10993082 DOI:10.1038/35024111
• Kang Y.K., Guermah M., Yuan C.-X., Roeder R.G. (2002). The TRAP/Mediator coactivator complex interacts directly with estrogen receptors alpha and beta through the TRAP220 subunit and directly enhances estrogen receptor function in vitro. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 2642—2647. PMID 11867769 DOI:10.1073/pnas.261715899
• Udayakumar T.S., Belakavadi M., Choi K.-H., Pandey P.K., Fondell J.D. (2006). Regulation of Aurora-A kinase gene expression via GABP recruitment of TRAP220/MED1. J. Biol. Chem. 281: 14691—14699. PMID 16574658 DOI:10.1074/jbc.M600163200
• Baek H.J., Kang Y.K., Roeder R.G. (2006). Human Mediator enhances basal transcription by facilitating recruitment of transcription factor IIB during preinitiation complex assembly. J. Biol. Chem. 281: 15172—15181. PMID 16595664 DOI:10.1074/jbc.M601983200
• Zhou H., Kim S., Ishii S., Boyer T.G. (2006). Mediator modulates Gli3-dependent Sonic hedgehog signaling. Mol. Cell. Biol. 26: 8667—8682. PMID 17000779 DOI:10.1128/MCB.00443-06

Див. також

• Хромосома 14