MACROD1

MACROD1 (англ. MACRO domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 325 амінокислот, а молекулярна маса — 35 505.

MACROD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2X47
Ідентифікатори
Символи	MACROD1, LRP16, MACRO domain containing 1, mono-ADP ribosylhydrolase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610400 MGI: 2147583 HomoloGene: 8549 GeneCards: MACROD1
Онтологія гена Молекулярна функція • deacetylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds • ADP-ribosylglutamate hydrolase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • purine nucleoside metabolic process • cellular response to DNA damage stimulus • protein de-ADP-ribosylation • peptidyl-glutamate ADP-deribosylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	28992	107227
Ensembl	ENSG00000133315	ENSMUSG00000036278
UniProt	Q9BQ69	Q922B1
RefSeq (мРНК)	NM_014067	NM_134147 NM_001378919 NM_001378920
RefSeq (білок)	NP_054786	NP_598908 NP_001365848 NP_001365849 NP_001390467 NP_001390469
Локус (UCSC)	Хр. 11: 64 – 64.17 Mb	Хр. 19: 7.03 – 7.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLQSRLSGR		LAQLRAAGQL		LVPPRPRPGH		LAGATRTRSS		TCGPPAFLGV
FGRRARTSAG		VGAWGAAAVG		RTAGVRTWAP		LAMAAKVDLS		TSTDWKEAKS
FLKGLSDKQR		EEHYFCKDFV		RLKKIPTWKE		MAKGVAVKVE		EPRYKKDKQL
NEKISLLRSD		ITKLEVDAIV		NAANSSLLGG		GGVDGCIHRA		AGPLLTDECR
TLQSCKTGKA		KITGGYRLPA		KYVIHTVGPI		AYGEPSASQA		AELRSCYLSS
LDLLLEHRLR		SVAFPCISTG		VFGYPCEAAA		EIVLATLREW		LEQHKDKVDR
LIICVFLEKD		EDIYRSRLPH		YFPVA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11