LSM11

LSM11 (англ. LSM11, U7 small nuclear RNA associated) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот, а молекулярна маса — 39 500.

LSM11
Ідентифікатори
Символи	LSM11, U7 small nuclear RNA associated, AGS8
Зовнішні ІД	OMIM: 617910 MGI: 1919540 HomoloGene: 32693 GeneCards: LSM11
Онтологія гена Молекулярна функція • U7 snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • U7 snRNP • histone pre-mRNA 3'end processing complex • клітинне ядро • telomerase holoenzyme complex • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage • histone mRNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	134353	72290
Ensembl	ENSG00000155858	ENSMUSG00000044847
UniProt	P83369	Q8BUV6
RefSeq (мРНК)	NM_173491	NM_028185
RefSeq (білок)	NP_775762	NP_082461
Локус (UCSC)	Хр. 5: 157.74 – 157.76 Mb	Хр. 11: 45.82 – 45.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEERERGARS		AGAGSPARPP		SPRLDVSSDS		FDPLLALYAP		RLPPIPYPNA
PCFNNVAEYE		SFLRTGVRGG		GRGRGRARGA		AAGSGVPAAP		GPSGRTRRRP
DAPAPDPERI		QRLRRLMVAK		EEGDGAAGAG		RRGPGRSRKA		PRNVLTRMPL
HEGSPLGELH		RCIREGVKVN		VHIRTFKGLR		GVCTGFLVAF		DKFWNMALTD
VDETYRKPVL		GKAYERDSSL		TLTRLFDRLK		LQDSSKKEAD		SKSAVEDSTL
SRYSQTSTWK		LASVWGRADT		GRGSHKRSRS		VPSSLQASAR		EESRSELSGR
TTRTDGSSVG		GTFSRATTLS		RGQSRKKKRK		PKVDYQQVFT		RHINQIFIRG
ENVLLVHLAQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pillai R.S., Will C.L., Luehrmann R., Schuemperli D., Mueller B. (2001). Purified U7 snRNPs lack the Sm proteins D1 and D2 but contain Lsm10, a new 14 kDa Sm D1-like protein. EMBO J. 20: 5470—5479. PMID 11574479 DOI:10.1093/emboj/20.19.5470
• Wagner E.J., Marzluff W.F. (2006). ZFP100, a component of the active U7 snRNP limiting for histone pre-mRNA processing, is required for entry into S phase. Mol. Cell. Biol. 26: 6702—6712. PMID 16914750 DOI:10.1128/MCB.00391-06

Див. також

• Хромосома 5