LRRTM1

LRRTM1 (англ. Leucine rich repeat transmembrane neuronal 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 58 641.

LRRTM1
Ідентифікатори
Символи	LRRTM1, entrez:347730, leucine rich repeat transmembrane neuronal 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610867 MGI: 2389173 HomoloGene: 41763 GeneCards: LRRTM1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase inhibitor activity • молекулярна функція Клітинна компонента • integral component of membrane • postsynaptic membrane • мембрана • growth cone • клітинна мембрана • синапс • excitatory synapse • cell surface • аксон • Міжклітинні контакти • ендоплазматичний ретикулум • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane Біологічний процес • locomotory behavior • negative regulation of protein kinase activity • cytokine-mediated signaling pathway • negative regulation of receptor internalization • synapse organization • exploration behavior • protein localization to synapse • Довготривала потенціація • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • positive regulation of synapse assembly • GO:0022610 життєдіяльність • regulation of postsynaptic density assembly • regulation of presynapse assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	347730	74342
Ensembl	ENSG00000162951	ENSMUSG00000060780
UniProt	Q86UE6	Q8K377
RefSeq (мРНК)	NM_178839	NM_028880 NM_001362109
RefSeq (білок)	NP_849161	NP_083156 NP_001349038
Локус (UCSC)	Хр. 2: 80.29 – 80.3 Mb	Хр. 6: 77.22 – 77.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDFLLLGLCL		YWLLRRPSGV		VLCLLGACFQ		MLPAAPSGCP		QLCRCEGRLL
YCEALNLTEA		PHNLSGLLGL		SLRYNSLSEL		RAGQFTGLMQ		LTWLYLDHNH
ICSVQGDAFQ		KLRRVKELTL		SSNQITQLPN		TTFRPMPNLR		SVDLSYNKLQ
ALAPDLFHGL		RKLTTLHMRA		NAIQFVPVRI		FQDCRSLKFL		DIGYNQLKSL
ARNSFAGLFK		LTELHLEHND		LVKVNFAHFP		RLISLHSLCL		RRNKVAIVVS
SLDWVWNLEK		MDLSGNEIEY		MEPHVFETVP		HLQSLQLDSN		RLTYIEPRIL
NSWKSLTSIT		LAGNLWDCGR		NVCALASWLN		NFQGRYDGNL		QCASPEYAQG
EDVLDAVYAF		HLCEDGAEPT		SGHLLSAVTN		RSDLGPPASS		ATTLADGGEG
QHDGTFEPAT		VALPGGEHAE		NAVQIHKVVT		GTMALIFSFL		IVVLVLYVSW
KCFPASLRQL		RQCFVTQRRK		QKQKQTMHQM		AAMSAQEYYV		DYKPNHIEGA
LVIINEYGSC		TCHQQPAREC		EV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Lauren J., Airaksinen M.S., Saarma M., Timmusk T.T. (2003). A novel gene family encoding leucine-rich repeat transmembrane proteins differentially expressed in the nervous system. Genomics. 81: 411—421. PMID 12676565 DOI:10.1016/S0888-7543(03)00030-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2