LRRK1

LRRK1 (англ. Leucine rich repeat kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 015 амінокислот, а молекулярна маса — 225 393.

LRRK1
Ідентифікатори
Символи	LRRK1, RIPK6, Roco1, leucine-rich repeat kinase 1, leucine rich repeat kinase 1, OSMD
Зовнішні ІД	OMIM: 610986 MGI: 2142227 HomoloGene: 23464 GeneCards: LRRK1
Онтологія гена Молекулярна функція • kinase activity • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • protein serine/threonine kinase activity • signal transducer activity Клітинна компонента • мітохондрія • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • osteoclast development • negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • GO:0010740 positive regulation of intracellular signal transduction • кісткова резорбція • фосфорилювання • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • GO:0007243 intracellular signal transduction • protein phosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79705	233328
Ensembl	ENSG00000154237	ENSMUSG00000015133
UniProt	Q38SD2	Q3UHC2
RefSeq (мРНК)	NM_024652 NM_001039843	NM_146191
RefSeq (білок)	NP_078928	NP_666303
Локус (UCSC)	Хр. 15: 100.92 – 101.08 Mb	Хр. 7: 65.88 – 66.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGMSQRPPS		MYWCVGPEES		AVCPERAMET		LNGAGDTGGK		PSTRGGDPAA
RSRRTEGIRA		AYRRGDRGGA		RDLLEEACDQ		CASQLEKGQL		LSIPAAYGDL
EMVRYLLSKR		LVELPTEPTD		DNPAVVAAYF		GHTAVVQELL		ESLPGPCSPQ
RLLNWMLALA		CQRGHLGVVK		LLVLTHGADP		ESYAVRKNEF		PVIVRLPLYA
AIKSGNEDIA		IFLLRHGAYF		CSYILLDSPD		PSKHLLRKYF		IEASPLPSSY
PGKTALRVKW		SHLRLPWVDL		DWLIDISCQI		TELDLSANCL		ATLPSVIPWG
LINLRKLNLS		DNHLGELPGV		QSSDEIICSR		LLEIDISSNK		LSHLPPGFLH
LSKLQKLTAS		KNCLEKLFEE		ENATNWIGLR		KLQELDISDN		KLTELPALFL
HSFKSLNSLN		VSRNNLKVFP		DPWACPLKCC		KASRNALECL		PDKMAVFWKN
HLKDVDFSEN		ALKEVPLGLF		QLDALMFLRL		QGNQLAALPP		QEKWTCRQLK
TLDLSRNQLG		KNEDGLKTKR		IAFFTTRGRQ		RSGTEAASVL		EFPAFLSESL
EVLCLNDNHL		DTVPPSVCLL		KSLSELYLGN		NPGLRELPPE		LGQLGNLWQL
DTEDLTISNV		PAEIQKEGPK		AMLSYLRAQL		RKAEKCKLMK		MIIVGPPRQG
KSTLLEILQT		GRAPQVVHGE		ATIRTTKWEL		QRPAGSRAKV		ESVEFNVWDI
GGPASMATVN		QCFFTDKALY		VVVWNLALGE		EAVANLQFWL		LNIEAKAPNA
VVLVVGTHLD		LIEAKFRVER		IATLRAYVLA		LCRSPSGSRA		TGFPDITFKH
LHEISCKSLE		GQEGLRQLIF		HVTCSMKDVG		STIGCQRLAG		RLIPRSYLSL
QEAVLAEQQR		RSRDDDVQYL		TDRQLEQLVE		QTPDNDIKDY		EDLQSAISFL
IETGTLLHFP		DTSHGLRNLY		FLDPIWLSEC		LQRIFNIKGS		RSVAKNGVIR
AEDLRMLLVG		TGFTQQTEEQ		YFQFLAKFEI		ALPVANDSYL		LPHLLPSKPG
LDTHGMRHPT		ANTIQRVFKM		SFVPVGFWQR		FIARMLISLA		EMDLQLFENK
KNTKSRNRKV		TIYSFTGNQR		NRCSTFRVKR		NQTIYWQEGL		LVTFDGGYLS
VESSDVNWKK		KKSGGMKIVC		QSEVRDFSAM		AFITDHVNSL		IDQWFPALTA
TESDGTPLME		QYVPCPVCET		AWAQHTDPSE		KSEDVQYFDM		EDCVLTAIER
DFISCPRHPD		LPVPLQELVP		ELFMTDFPAR		LFLENSKLEH		SEDEGSVLGQ
GGSGTVIYRA		RYQGQPVAVK		RFHIKKFKNF		ANVPADTMLR		HLRATDAMKN
FSEFRQEASM		LHALQHPCIV		ALIGISIHPL		CFALELAPLS		SLNTVLSENA
RDSSFIPLGH		MLTQKIAYQI		ASGLAYLHKK		NIIFCDLKSD		NILVWSLDVK
EHINIKLSDY		GISRQSFHEG		ALGVEGTPGY		QAPEIRPRIV		YDEKVDMFSY
GMVLYELLSG		QRPALGHHQL		QIAKKLSKGI		RPVLGQPEEV		QFRRLQALMM
ECWDTKPEKR		PLALSVVSQM		KDPTFATFMY		ELCCGKQTAF		FSSQGQEYTV
VFWDGKEESR		NYTVVNTEKG		LMEVQRMCCP		GMKVSCQLQV		QRSLWTATED
QKIYIYTLKG		MCPLNTPQQA		LDTPAVVTCF		LAVPVIKKNS		YLVLAGLADG
LVAVFPVVRG		TPKDSCSYLC		SHTANRSKFS		IADEDARQNP		YPVKAMEVVN
SGSEVWYSNG		PGLLVIDCAS		LEICRRLEPY		MAPSMVTSVV		CSSEGRGEEV
VWCLDDKANS		LVMYHSTTYQ		LCARYFCGVP		SPLRDMFPVR		PLDTEPPAAS
HTANPKVPEG		DSIADVSIMY		SEELGTQILI		HQESLTDYCS		MSSYSSSPPR
QAARSPSSLP		SSPASSSSVP		FSTDCEDSDM		LHTPGAASDR		SEHDLTPMDG
ETFSQHLQAV		KILAVRDLIW		VPRRGGDVIV		IGLEKDSGAQ		RGRVIAVLKA
RELTPHGVLV		DAAVVAKDTV		VCTFENENTE		WCLAVWRGWG		AREFDIFYQS
YEELGRLEAC		TRKRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, ГТФ, іоном магнію, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85

Див. також

• Хромосома 15