LNX1

LNX1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3B76
Ідентифікатори
Символи	LNX1, LNX, MPDZ, PDZRN2, ligand of numb-protein X 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609732 MGI: 1278335 HomoloGene: 7819 GeneCards: LNX1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• PDZ domain binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • transferase activity; • zinc ion binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма;
Біологічний процес	• protein homooligomerization; • Убіквітин-залежний протеоліз; • ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	84708
	16924
	ENSG00000072201
	ENSMUSG00000029228
	Q8TBB1
	O70263
	NM_001126328; NM_032622
NM_001159577; NM_001159578; NM_001159579; NM_001159580; NM_010727;
	NM_001359074
	NP_001119800; NP_116011
NP_001153049; NP_001153050; NP_001153051; NP_001153052; NP_034857;
	NP_001346003
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LNX1 (англ. Ligand of numb-protein X 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 728 амінокислот, а молекулярна маса — 80 629^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNQPESANDP	EPLCAVCGQA	HSLEENHFYS	YPEEVDDDLI	CHICLQALLD
PLDTPCGHTY	CTLCLTNFLV	EKDFCPMDRK	PLVLQHCKKS	SILVNKLLNK
LLVTCPFREH	CTQVLQRCDL	EHHFQTSCKG	ASHYGLTKDR	KRRSQDGCPD
GCASLTATAP	SPEVSAAATI	SLMTDEPGLD	NPAYVSSAED	GQPAISPVDS
GRSNRTRARP	FERSTIRSRS	FKKINRALSV	LRRTKSGSAV	ANHADQGREN
SENTTAPEVF	PRLYHLIPDG	EITSIKINRV	DPSESLSIRL	VGGSETPLVH
IIIQHIYRDG	VIARDGRLLP	GDIILKVNGM	DISNVPHNYA	VRLLRQPCQV
LWLTVMREQK	FRSRNNGQAP	DAYRPRDDSF	HVILNKSSPE	EQLGIKLVRK
VDEPGVFIFN	VLDGGVAYRH	GQLEENDRVL	AINGHDLRYG	SPESAAHLIQ
ASERRVHLVV	SRQVRQRSPD	IFQEAGWNSN	GSWSPGPGER	SNTPKPLHPT
ITCHEKVVNI	QKDPGESLGM	TVAGGASHRE	WDLPIYVISV	EPGGVISRDG
RIKTGDILLN	VDGVELTEVS	RSEAVALLKR	TSSSIVLKAL	EVKEYEPQED
CSSPAALDSN	HNMAPPSDWS	PSWVMWLELP	RCLYNCKDIV	LRRNTAGSLG
FCIVGGYEEY	NGNKPFFIKS	IVEGTPAYND	GRIRCGDILL	AVNGRSTSGM
IHACLARLLK	ELKGRITLTI	VSWPGTFL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Doyle J.M., Gao J., Wang J., Yang M., Potts P.R. (2010). MAGE-RING protein complexes comprise a family of E3 ubiquitin ligases. Mol. Cell. 39: 963—974. PMID 20864041 DOI:10.1016/j.molcel.2010.08.029

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6657 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8TBB1 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6657 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8TBB1 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]