LIME1

LIME1 (англ. Lck interacting transmembrane adaptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 295 амінокислот, а молекулярна маса — 31 288.

LIME1
Ідентифікатори
Символи	LIME1, LIME, LP8067, dJ583P15.4, Lck interacting transmembrane adaptor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609809 MGI: 1919949 HomoloGene: 56785 GeneCards: LIME1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • міжклітинний простір • U2-type post-mRNA release spliceosomal complex • B cell receptor complex Біологічний процес • B cell receptor signaling pathway • T cell receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • spliceosomal complex disassembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • regulation of MAP kinase activity • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol • regulation of NIK/NF-kappaB signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54923	72699
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000090077
UniProt	Q9H400	Q9EQR5
RefSeq (мРНК)	NM_017806 NM_001305654 NM_001305655	NM_023684
RefSeq (білок)	NP_001292583 NP_001292584 NP_060276	NP_076173
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 2: 181.02 – 181.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLPVSWAPP		ALWVLGCCAL		LLSLWALCTA		CRRPEDAVAP		RKRARRQRAR
LQGSATAAEA		SLLRRTHLCS		LSKSDTRLHE		LHRGPRSSRA		LRPASMDLLR
PHWLEVSRDI		TGPQAAPSAF		PHQELPRALP		AAAATAGCAG		LEATYSNVGL
AALPGVSLAA		SPVVAEYARV		QKRKGTHRSP		QEPQQGKTEV		TPAAQVDVLY
SRVCKPKRRD		PGPTTDPLDP		KGQGAILALA		GDLAYQTLPL		RALDVDSGPL
ENVYESIREL		GDPAGRSSTC		GAGTPPASSC		PSLGRGWRPL		PASLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20