LIMCH1

LIMCH1 (англ. LIM and calponin homology domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 083 амінокислот, а молекулярна маса — 121 867.

LIMCH1
Ідентифікатори
Символи	LIMCH1, LIMCH1A, LMO7B, LIM and calponin homology domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 617750 MGI: 1924819 HomoloGene: 18953 GeneCards: LIMCH1
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • зв'язування з іоном металу • myosin II head/neck binding Клітинна компонента • stress fiber • myosin II complex • цитоплазма • цитоскелет Біологічний процес • actomyosin structure organization • positive regulation of protein phosphorylation • negative regulation of cell migration • positive regulation of stress fiber assembly • regulation of focal adhesion assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22998	77569
Ensembl	ENSG00000064042	ENSMUSG00000037736
UniProt	Q9UPQ0	Q3UH68
RefSeq (мРНК)	NM_001112717 NM_001112718 NM_001112719 NM_001112720 NM_001289122 NM_001289124 NM_014988 NM_001330672 NM_001330674 NM_001330784 NM_001330786 NM_001330787 NM_001330788 NM_001330789 NM_001330790 NM_001330791 NM_001330792 NM_001330793 NM_001330982 NM_001330983	NM_001001980 NM_001256122 NM_001368863
RefSeq (білок)	NP_001106188 NP_001106189 NP_001106190 NP_001106191 NP_001276051 NP_001276053 NP_001317601 NP_001317603 NP_001317713 NP_001317715 NP_001317716 NP_001317717 NP_001317718 NP_001317719 NP_001317720 NP_001317721 NP_001317722 NP_001317911 NP_001317912 NP_055803	NP_001001980 NP_001243051 NP_001355792 NP_001388339 NP_001388340 NP_001388341 NP_001388342 NP_001388343 NP_001388344 NP_001388345 NP_001388346 NP_001388347 NP_001388348 NP_001388349 NP_001388350 NP_001388351 NP_001388352 NP_001388353 NP_001388354 NP_001388355 NP_001388356 NP_001390437 NP_001390438
Локус (UCSC)	Хр. 4: 41.36 – 41.7 Mb	Хр. 5: 66.75 – 67.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MACPALGLEA		LQPLQPEPPP		EPAFSEAQKW		IEQVTGRSFG		DKDFRTGLEN
GILLCELLNA		IKPGLVKKIN		RLPTPIAGLD		NIILFLRGCK		ELGLKESQLF
DPSDLQDTSN		RVTVKSLDYS		RKLKNVLVTI		YWLGKAANSC		TSYSGTTLNL
KEFEGLLAQM		RKDTDDIESP		KRSIRDSGYI		DCWDSERSDS		LSPPRHGRDD
SFDSLDSFGS		RSRQTPSPDV		VLRGSSDGRG		SDSESDLPHR		KLPDVKKDDM
SARRTSHGEP		KSAVPFNQYL		PNKSNQTAYV		PAPLRKKKAE		REEYRKSWST
ATSPLGGERP		FRYGPRTPVS		DDAESTSMFD		MRCEEEAAVQ		PHSRARQEQL
QLINNQLREE		DDKWQDDLAR		WKSRRRSVSQ		DLIKKEEERK		KMEKLLAGED
GTSERRKSIK		TYREIVQEKE		RRERELHEAY		KNARSQEEAE		GILQQYIERF
TISEAVLERL		EMPKILERSH		STEPNLSSFL		NDPNPMKYLR		QQSLPPPKFT
ATVETTIARA		SVLDTSMSAG		SGSPSKTVTP		KAVPMLTPKP		YSQPKNSQDV
LKTFKVDGKV		SVNGETVHRE		EEKERECPTV		APAHSLTKSQ		MFEGVARVHG
SPLELKQDNG		SIEINIKKPN		SVPQELAATT		EKTEPNSQED		KNDGGKSRKG
NIELASSEPQ		HFTTTVTRCS		PTVAFVEFPS		SPQLKNDVSE		EKDQKKPENE
MSGKVELVLS		QKVVKPKSPE		PEATLTFPFL		DKMPEANQLH		LPNLNSQVDS
PSSEKSPVMT		PQFKFWAWDP		EEERRRQEKW		QQEQERLLQE		RYQKEQDKLK
EEWEKAQKEV		EEEERRYYEE		ERKIIEDTVV		PFTVSSSSAD		QLSTSSSMTE
GSGTMNKIDL		GNCQDEKQDR		RWKKSFQGDD		SDLLLKTRES		DRLEEKGSLT
EGALAHSGNP		VSKGVHEDHQ		LDTEAGAPHC		GTNPQLAQDP		SQNQQTSNPT
HSSEDVKPKT		LPLDKSINHQ		IESPSERRKK		SPREHFQAGP		FSPCSPTPPG
QSPNRSISGK		KLCSSCGLPL		GKGAAMIIET		LNLYFHIQCF		RCGICKGQLG
DAVSGTDVRI		RNGLLNCNDC		YMRSRSAGQP		TTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 4