LDHC

LDHC (англ. Lactate dehydrogenase C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 332 амінокислот, а молекулярна маса — 36 311.

LDHC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LDX
Ідентифікатори
Символи	LDHC, CT32, LDH3, LDHX, lactate dehydrogenase C
Зовнішні ІД	OMIM: 150150 MGI: 96764 HomoloGene: 22767 GeneCards: LDHC
Пов'язані генетичні захворювання
бічний аміотрофічний склероз
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor • oxidoreductase activity • каталітична активність • L-lactate dehydrogenase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • motile cilium • війка • екзосома • клітинне ядро Біологічний процес • flagellated sperm motility • lactate oxidation • pyruvate metabolic process • ATP biosynthetic process • lactate biosynthetic process from pyruvate • carboxylic acid metabolic process • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3948	16833
Ensembl	ENSG00000166796	ENSMUSG00000030851
UniProt	P07864	P00342
RefSeq (мРНК)	NM_017448 NM_002301	NM_013580 NM_001368361 NM_001368362
RefSeq (білок)	NP_002292 NP_059144	NP_038608 NP_001355290 NP_001355291
Локус (UCSC)	Хр. 11: 18.41 – 18.45 Mb	Хр. 7: 46.51 – 46.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTVKEQLIE		KLIEDDENSQ		CKITIVGTGA		VGMACAISIL		LKDLADELAL
VDVALDKLKG		EMMDLQHGSL		FFSTSKITSG		KDYSVSANSR		IVIVTAGARQ
QEGETRLALV		QRNVAIMKSI		IPAIVHYSPD		CKILVVSNPV		DILTYIVWKI
SGLPVTRVIG		SGCNLDSARF		RYLIGEKLGV		HPTSCHGWII		GEHGDSSVPL
WSGVNVAGVA		LKTLDPKLGT		DSDKEHWKNI		HKQVIQSAYE		IIKLKGYTSW
AIGLSVMDLV		GSILKNLRRV		HPVSTMVKGL		YGIKEELFLS		IPCVLGRNGV
SDVVKINLNS		EEEALFKKSA		ETLWNIQKDL		IF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Millan J.L., Driscoll C.E., Goldberg E. (1987). Epitopes of human testis-specific lactate dehydrogenase deduced from a cDNA sequence. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 5311—5315. PMID 2440048 DOI:10.1073/pnas.84.15.5311
• Takano T., Li S.S.-L. (1989). Human testicular lactate dehydrogenase-C gene is interrupted by six introns at positions homologous to those of LDH-A (muscle) and LDH-B (heart) genes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 159: 579—583. PMID 2930531 DOI:10.1016/0006-291X(89)90033-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wu K., Li S.S.-L. (1990). Human testicular lactate dehydrogenase-C gene: cDNA sequence and putative alternative splicing at the 5' noncoding region. J. Genet. Mol. Biol. 1: 72—76.

Див. також

• Хромосома 11