LARP4B

LARP4B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3PTH
Ідентифікатори
Символи	LARP4B, KIAA0217, LARP5, La ribonucleoprotein domain family member 4B, La ribonucleoprotein 4B
Зовнішні ІД	OMIM: 616513 MGI: 106330 HomoloGene: 18195 GeneCards: LARP4B
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • cytoplasmic stress granule; • ядерце; • мембрана; • polysomal ribosome; • цитоплазма;
Біологічний процес	• regulation of translation; • positive regulation of translation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23185
	217980
	ENSG00000107929
	ENSMUSG00000033499
	Q92615
	Q6A0A2
	NM_015155; NM_001351277
	NM_172585; NM_001311117
	NP_055970; NP_001338206
	NP_001298046; NP_766173
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LARP4B (англ. La ribonucleoprotein domain family member 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 738 амінокислот, а молекулярна маса — 80 552^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSDQDAKVV	AEPQTQRVQE	GKDSAHLMNG	PISQTTSQTS	SIPPLSQVPA
TKVSELNPNA	EVWGAPVLHL	EASSAADGVS	AAWEEVAGHH	ADRGPQGSDA
NGDGDQGHEN	AALPDPQESD	PADMNALALG	PSEYDSLPEN	SETGGNESQP
DSQEDPREVL	KKTLEFCLSR	ENLASDMYLI	SQMDSDQYVP	ITTVANLDHI
KKLSTDVDLI	VEVLRSLPLV	QVDEKGEKVR	PNQNRCIVIL	REISESTPVE
EVEALFKGDN	LPKFINCEFA	YNDNWFITFE	TEADAQQAYK	YLREEVKTFQ
GKPIKARIKA	KAIAINTFLP	KNGFRPLDVS	LYAQQRYATS	FYFPPMYSPQ
QQFPLYSLIT	PQTWSATHSY	LDPPLVTPFP	NTGFINGFTS	PAFKPAASPL
TSLRQYPPRS	RNPSKSHLRH	AIPSAERGPG	LLESPSIFNF	TADRLINGVR
SPQTRQAGQT	RTRIQNPSAY	AKREAGPGRV	EPGSLESSPG	LGRGRKNSFG
YRKKREEKFT	SSQTQSPTPP	KPPSPSFELG	LSSFPPLPGA	AGNLKTEDLF
ENRLSSLIIG	PSKERTLSAD	ASVNTLPVVV	SREPSVPASC	AVSATYERSP
SPAHLPDDPK	VAEKQRETHS	VDRLPSALTA	TACKSVQVNG	AATELRKPSY
AEICQRTSKE	PPSSPLQPQK	EQKPNTVGCG	KEEKKLAEPA	ERYREPPALK
STPGAPRDQR	RPAGGRPSPS	AMGKRLSREQ	STPPKSPQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, ацетилювання, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r