LAMP2

LAMP2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2MOF, 2MOM
Ідентифікатори
Символи	LAMP2, CD107b, LAMP-2, LAMPB, LGP110, lysosomal associated membrane protein 2, LGP-96, DND
Зовнішні ІД	OMIM: 309060 MGI: 96748 HomoloGene: 7809 GeneCards: LAMP2
Пов'язані генетичні захворювання
	Danon disease
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • enzyme binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • membrane microdomain; • ендосома; • late endosome; • phagocytic vesicle membrane; • chaperone-mediated autophagy translocation complex; • мембрана; • late endosome membrane; • клітинна мембрана; • lysosomal membrane; • lysosomal lumen; • platelet dense granule membrane; • лізосома; • endosome membrane; • екзосома; • autophagosome membrane; • міжклітинний простір; • trans-Golgi network; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • azurophil granule membrane; • autolysosome; • perinuclear region of cytoplasm; • integral component of autophagosome membrane; • ficolin-1-rich granule membrane; • membrane raft; • lysosomal matrix;
Біологічний процес	• regulation of protein stability; • muscle cell cellular homeostasis; • protein stabilization; • platelet degranulation; • protein import; • сортування білків; • автофагія; • cellular response to starvation; • negative regulation of protein homooligomerization; • neutrophil degranulation; • chaperone-mediated autophagy; • protein targeting to lysosome involved in chaperone-mediated autophagy; • GO:0000046 autophagosome maturation; • lysosomal protein catabolic process; • establishment of protein localization to organelle;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3920
	16784
	ENSG00000005893
	ENSMUSG00000016534
	P13473
	P17047
	NM_013995; NM_001122606; NM_002294
	NM_001017959; NM_001290485; NM_010685
	NP_001116078; NP_002285; NP_054701
	NP_001017959; NP_001277414; NP_034815
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LAMP2 (англ. Lysosomal associated membrane protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 410 амінокислот, а молекулярна маса — 44 961^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVCFRLFPVP	GSGLVLVCLV	LGAVRSYALE	LNLTDSENAT	CLYAKWQMNF
TVRYETTNKT	YKTVTISDHG	TVTYNGSICG	DDQNGPKIAV	QFGPGFSWIA
NFTKAASTYS	IDSVSFSYNT	GDNTTFPDAE	DKGILTVDEL	LAIRIPLNDL
FRCNSLSTLE	KNDVVQHYWD	VLVQAFVQNG	TVSTNEFLCD	KDKTSTVAPT
IHTTVPSPTT	TPTPKEKPEA	GTYSVNNGND	TCLLATMGLQ	LNITQDKVAS
VININPNTTH	STGSCRSHTA	LLRLNSSTIK	YLDFVFAVKN	ENRFYLKEVN
ISMYLVNGSV	FSIANNNLSY	WDAPLGSSYM	CNKEQTVSVS	GAFQINTFDL
RVQPFNVTQG	KYSTAQDCSA	DDDNFLVPIA	VGAALAGVLI	LVLLAYFIGL
KHHHAGYEQF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література ред.

Konecki D.S., Foetisch K., Schlotter M., Lichter-Konecki U. (1994). Complete cDNA sequence of human lysosome-associated membrane protein-2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 205: 1—5. PMID 7999007 DOI:10.1006/bbrc.1994.2620
Konecki D.S., Foetisch K., Zimmer K.P., Schlotter M., Lichter-Konecki U. (1995). An alternatively spliced form of the human lysosome-associated membrane protein-2 gene is expressed in a tissue-specific manner. Biochem. Biophys. Res. Commun. 215: 757—767. PMID 7488019 DOI:10.1006/bbrc.1995.2528
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Carlsson S.R., Lycksell P.-O., Fukuda M. (1993). Assignment of O-glycan attachment sites to the hinge-like regions of human lysosomal membrane glycoproteins lamp-1 and lamp-2. Arch. Biochem. Biophys. 304: 65—73. PMID 8323299 DOI:10.1006/abbi.1993.1322
Cuervo A.M., Dice J.F. (1996). A receptor for the selective uptake and degradation of proteins by lysosomes. Science. 273: 501—503. PMID 8662539 DOI:10.1126/science.273.5274.501