CCAR2

CCAR2 (англ. Cell cycle and apoptosis regulator 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 923 амінокислот, а молекулярна маса — 102 902.

CCAR2
Ідентифікатори
Символи	CCAR2, DBC-1, DBC1, KIAA1967, NET35, p30 DBC, p30DBC, cell cycle and apoptosis regulator 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607359 MGI: 2444228 HomoloGene: 10910 GeneCards: CCAR2
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA polymerase II complex binding • GO:0048551 enzyme inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • RNA binding • nuclear receptor coactivator activity Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • DBIRD complex • мітохондріальний матрикс • spliceosomal complex • клітинне ядро Біологічний процес • mitochondrial fragmentation involved in apoptotic process • GO:0048553 negative regulation of catalytic activity • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of protein stability • positive regulation of DNA damage checkpoint • ритмічний процес • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • mRNA processing • regulation of DNA-templated transcription, elongation • regulation of protein deacetylation • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • Wnt signaling pathway • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • regulation of circadian rhythm • negative regulation of cell growth • Сплайсинг РНК • negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of apoptotic process • regulation of cellular response to heat • клітинний цикл • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • response to UV • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57805	219158
Ensembl	ENSG00000158941	ENSMUSG00000033712
UniProt	Q8N163	Q8VDP4
RefSeq (мРНК)	NM_021174 NM_199205 NM_001363068 NM_001363069 NM_001393997	NM_146055
RefSeq (білок)	NP_066997 NP_001349997 NP_001349998	NP_666167
Локус (UCSC)	Хр. 8: 22.6 – 22.62 Mb	Хр. 14: 70.38 – 70.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQFKRQRIN		PLPGGRNFSG		TASTSLLGPP		PGLLTPPVAT		ELSQNARHLQ
GGEKQRVFTG		IVTSLHDYFG		VVDEEVFFQL		SVVKGRLPQL		GEKVLVKAAY
NPGQAVPWNA		VKVQTLSNQP		LLKSPAPPLL		HVAALGQKQG		ILGAQPQLIF
QPHRIPPLFP		QKPLSLFQTS		HTLHLSHLNR		FPARGPHGRL		DQGRSDDYDS
KKRKQRAGGE		PWGAKKPRHD		LPPYRVHLTP		YTVDSPICDF		LELQRRYRSL
LVPSDFLSVH		LSWLSAFPLS		QPFSLHHPSR		IQVSSEKEAA		PDAGAEPITA
DSDPAYSSKV		LLLSSPGLEE		LYRCCMLFVD		DMAEPRETPE		HPLKQIKFLL
GRKEEEAVLV		GGEWSPSLDG		LDPQADPQVL		VRTAIRCAQA		QTGIDLSGCT
KWWRFAEFQY		LQPGPPRRLQ		TVVVYLPDVW		TIMPTLEEWE		ALCQQKAAEA
APPTQEAQGE		TEPTEQAPDA		LEQAADTSRR		NAETPEATTQ		QETDTDLPEA
PPPPLEPAVI		ARPGCVNLSL		HGIVEDRRPK		ERISFEVMVL		AELFLEMLQR
DFGYRVYKML		LSLPEKVVSP		PEPEKEEAAK		EEATKEEEAI		KEEVVKEPKD
EAQNEGPATE		SEAPLKEDGL		LPKPLSSGGE		EEEKPRGEAS		EDLCEMALDP
ELLLLRDDGE		EEFAGAKLED		SEVRSVASNQ		SEMEFSSLQD		MPKELDPSAV
LPLDCLLAFV		FFDANWCGYL		HRRDLERILL		TLGIRLSAEQ		AKQLVSRVVT
QNICQYRSLQ		YSRQEGLDGG		LPEEVLFGNL		DLLPPPGKST		KPGAAPTEHK
ALVSHNGSLI		NVGSLLQRAE		QQDSGRLYLE		NKIHTLELKL		EESHNRFSAT
EVTNKTLAAE		MQELRVRLAE		AEETARTAER		QKSQLQRLLQ		ELRRRLTPLQ
LEIQRVVEKA		DSWVEKEEPA		PSN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, інгібіторів металоферментів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, пошкодження ДНК, біологічні ритми, сигнальний шлях Wnt. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
• Kim J.-E., Chen J., Lou Z. (2008). DBC1 is a negative regulator of SIRT1. Nature. 451: 583—586. PMID 18235501 DOI:10.1038/nature06500
• Chini C.C., Escande C., Nin V., Chini E.N. (2010). HDAC3 is negatively regulated by the nuclear protein DBC1. J. Biol. Chem. 285: 40830—40837. PMID 21030595 DOI:10.1074/jbc.M110.153270
• Zannini L., Buscemi G., Kim J.E., Fontanella E., Delia D. (2012). DBC1 phosphorylation by ATM/ATR inhibits SIRT1 deacetylase in response to DNA damage. J. Mol. Cell Biol. 4: 294—303. PMID 22735644 DOI:10.1093/jmcb/mjs035
• Chini C.C., Escande C., Nin V., Chini E.N. (2013). DBC1 (Deleted in Breast Cancer 1) modulates the stability and function of the nuclear receptor Rev-erbalpha. Biochem. J. 451: 453—461. PMID 23398316 DOI:10.1042/BJ20121085

Див. також

• Хромосома 8