KHDRBS2

KHDRBS2 (англ. KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 349 амінокислот, а молекулярна маса — 38 927.

KHDRBS2
Ідентифікатори
Символи	KHDRBS2, SLM-1, SLM1, bA535F17.1, KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 2, KH RNA binding domain containing, signal transduction associated 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610487 MGI: 2159649 HomoloGene: 15772 GeneCards: KHDRBS2
Онтологія гена Молекулярна функція • SH3 domain binding • nucleic acid binding • SH2 domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • poly(A) binding • RNA binding • protein heterodimerization activity • poly(U) RNA binding • identical protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • mRNA processing • regulation of mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	202559	170771
Ensembl	ENSG00000112232	ENSMUSG00000026058
UniProt	Q5VWX1	Q9WU01
RefSeq (мРНК)	NM_152688 NM_001350622	NM_133235
RefSeq (білок)	NP_689901 NP_001337551	NP_573498
Локус (UCSC)	Хр. 6: 61.68 – 62.29 Mb	Хр. 1: 32.21 – 32.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEEKYLPEL		MAEKDSLDPS		FVHASRLLAE		EIEKFQGSDG		KKEDEEKKYL
DVISNKNIKL		SERVLIPVKQ		YPKFNFVGKL		LGPRGNSLKR		LQEETGAKMS
ILGKGSMRDK		AKEEELRKSG		EAKYAHLSDE		LHVLIEVFAP		PGEAYSRMSH
ALEEIKKFLV		PDYNDEIRQE		QLRELSYLNG		SEDSGRGRGI		RGRGIRIAPT
APSRGRGGAI		PPPPPPGRGV		LTPRGSTVTR		GALPVPPVAR		GVPTPRARGA
PTVPGYRAPP		PPAHEAYEEY		GYDDGYGGEY		DDQTYETYDN		SYATQTQSVP
EYYDYGHGVS		EDAYDSYAPE		EWATTRSSLK		APPQRSARGG		YREHPYGRY

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cote J., Boisvert F.-M., Boulanger M.-C., Bedford M.T., Richard S. (2003). Sam68 RNA binding protein is an in vivo substrate for protein arginine N-methyltransferase 1. Mol. Biol. Cell. 14: 274—287. PMID 12529443 DOI:10.1091/mbc.E02-08-0484

Див. також

• Хромосома 6