KDM8

KDM8 (англ. Lysine demethylase 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 416 амінокислот, а молекулярна маса — 47 270.

KDM8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3UYJ, 4AAP, 4GAZ, 4GJY, 4GJZ, 4QU1
Ідентифікатори
Символи	KDM8, JMJD5, lysine demethylase 8
Зовнішні ІД	OMIM: 611917 MGI: 1924285 HomoloGene: 49791 GeneCards: KDM8
Онтологія гена Молекулярна функція • dioxygenase activity • chromatin binding • oxidoreductase activity • зв'язування з іоном металу • histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity • histone demethylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • aminopeptidase activity • endopeptidase activity • 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity • methylated histone binding Клітинна компонента • клітинне ядро • Нуклеоплазма • гіалоплазма • хромосома Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • клітинний цикл • G2/M transition of mitotic cell cycle • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • histone H3-K36 demethylation • transcription, DNA-templated • протеоліз • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • protein destabilization • circadian regulation of gene expression • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79831	77035
Ensembl	ENSG00000155666	ENSMUSG00000030752
UniProt	Q8N371	Q9CXT6
RefSeq (мРНК)	NM_001145348 NM_024773	NM_029842
RefSeq (білок)	NP_001138820 NP_079049	NP_084118
Локус (UCSC)	Хр. 16: 27.2 – 27.22 Mb	Хр. 7: 125.04 – 125.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGDTHCPAE		PLAREGTLWE		ALRALLPHSK		EDLKLDLGEK		VERSVVTLLQ
RATELFYEGR		RDECLQSSEV		ILDYSWEKLN		TGTWQDVDKD		WRRVYAIGCL
LKALCLCQAP		EDANTVAAAL		RVCDMGLLMG		AAILGDILLK		VAAILQTHLP
GKRPARGSLP		EQPCTKKARA		DHGLIPDVKL		EKTVPRLHRP		SLQHFREQFL
VPGRPVILKG		VADHWPCMQK		WSLEYIQEIA		GCRTVPVEVG		SRYTDEEWSQ
TLMTVNEFIS		KYIVNEPRDV		GYLAQHQLFD		QIPELKQDIS		IPDYCSLGDG
EEEEITINAW		FGPQGTISPL		HQDPQQNFLV		QVMGRKYIRL		YSPQESGALY
PHDTHLLHNT		SQVDVENPDL		EKFPKFAKAP		FLSCILSPGE		ILFIPVKYWH
YVRALDLSFS		VSFWWS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16