IMPG1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
IMPG1 (англ. Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 89 387[4].
IMPG1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | IMPG1, GP147, IPM150, SPACR, VMD4, interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, RP91 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602870 MGI: 1926876 HomoloGene: 1201 GeneCards: IMPG1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() |
|||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 75.92 – 76.07 Mb | Хр. 9: 80.22 – 80.35 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MYLETRRAIF | VFWIFLQVQG | TKDISINIYH | SETKDIDNPP | RNETTESTEK | ||||
MYKMSTMRRI | FDLAKHRTKR | SAFFPTGVKV | CPQESMKQIL | DSLQAYYRLR | ||||
VCQEAVWEAY | RIFLDRIPDT | GEYQDWVSIC | QQETFCLFDI | GKNFSNSQEH | ||||
LDLLQQRIKQ | RSFPDRKDEI | SAEKTLGEPG | ETIVISTDVA | NVSLGPFPLT | ||||
PDDTLLNEIL | DNTLNDTKMP | TTERETEFAV | LEEQRVELSV | SLVNQKFKAE | ||||
LADSQSPYYQ | ELAGKSQLQM | QKIFKKLPGF | KKIHVLGFRP | KKEKDGSSST | ||||
EMQLTAIFKR | HSAEAKSPAS | DLLSFDSNKI | ESEEVYHGTM | EEDKQPEIYL | ||||
TATDLKRLIS | KALEEEQSLD | VGTIQFTDEI | AGSLPAFGPD | TQSELPTSFA | ||||
VITEDATLSP | ELPPVEPQLE | TVDGAEHGLP | DTSWSPPAMA | STSLSEAPPF | ||||
FMASSIFSLT | DQGTTDTMAT | DQTMLVPGLT | IPTSDYSAIS | QLALGISHPP | ||||
ASSDDSRSSA | GGEDMVRHLD | EMDLSDTPAP | SEVPELSEYV | SVPDHFLEDT | ||||
TPVSALQYIT | TSSMTIAPKG | RELVVFFSLR | VANMAFSNDL | FNKSSLEYRA | ||||
LEQQFTQLLV | PYLRSNLTGF | KQLEILNFRN | GSVIVNSKMK | FAKSVPYNLT | ||||
KAVHGVLEDF | RSAAAQQLHL | EIDSYSLNIE | PADQADPCKF | LACGEFAQCV | ||||
KNERTEEAEC | RCKPGYDSQG | SLDGLEPGLC | GPGTKECEVL | QGKGAPCRLP | ||||
DHSENQAYKT | SVKKFQNQQN | NKVISKRNSE | LLTVEYEEFN | HQDWEGN |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Секретований назовні.
Література
ред.- Kuehn M.H., Hageman G.S. (1999). Expression and characterization of the IPM 150 gene (IMPG1) product, a novel human photoreceptor cell-associated chondroitin-sulfate proteoglycan. Matrix Biol. 18: 509—518. PMID 10601738 DOI:10.1016/S0945-053X(99)00043-8
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Acharya S., Rayborn M.E., Hollyfield J.G. (1998). Characterization of SPACR, a sialoprotein associated with cones and rods present in the interphotoreceptor matrix of the human retina: immunological and lectin binding analysis. Glycobiology. 8: 997—1006. PMID 9719680 DOI:10.1093/glycob/8.10.997
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6055 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q17R60 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |