IKBKB

IKBKB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4KIK, 3BRT, 3BRV, 4E3C
Ідентифікатори
Символи	IKBKB, IKK-beta, IKK2, IKKB, IMD15, NFKBIKB, inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase beta, inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit beta, IMD15A, IMD15B
Зовнішні ІД	OMIM: 603258 MGI: 1338071 HomoloGene: 7782 GeneCards: IKBKB
Пов'язані генетичні захворювання
	severe combined immunodeficiency due to IKK2 deficiency
Реагує на сполуку
	bms-345541 free base
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • protein kinase activity; • IkappaB kinase activity; • nucleotide binding; • protein homodimerization activity; • scaffold protein binding; • kinase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ATP binding; • protein kinase binding; • protein heterodimerization activity; • protein serine/threonine kinase activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • membrane raft; • CD40 receptor complex; • cytoplasmic side of plasma membrane; • клітинне ядро; • IkappaB kinase complex; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• фосфорилювання; • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • cellular response to tumor necrosis factor; • response to virus; • regulation of phosphorylation; • negative regulation of apoptotic process; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • T cell receptor signaling pathway; • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • protein phosphorylation; • negative regulation of bicellular tight junction assembly; • stress-activated MAPK cascade; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • negative regulation of myosin-light-chain-phosphatase activity; • вроджений імунітет; • inflammatory response; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • GO:0033109 cortical actin cytoskeleton organization; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of establishment of endothelial barrier; • I-kappaB phosphorylation; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • anatomical structure morphogenesis; • protein localization to plasma membrane; • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • interleukin-1-mediated signaling pathway; • GO:0022415 viral process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3551
	16150
	ENSG00000104365
	ENSMUSG00000031537
	O14920
	O88351
	NM_001190720; NM_001190721; NM_001190722; NM_001242778; NM_001556
	NM_001159774; NM_010546
	NP_001177649; NP_001229707; NP_001547
	NP_001153246; NP_034676
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IKBKB (англ. Inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 756 амінокислот, а молекулярна маса — 86 564^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSWSPSLTTQ	TCGAWEMKER	LGTGGFGNVI	RWHNQETGEQ	IAIKQCRQEL
SPRNRERWCL	EIQIMRRLTH	PNVVAARDVP	EGMQNLAPND	LPLLAMEYCQ
GGDLRKYLNQ	FENCCGLREG	AILTLLSDIA	SALRYLHENR	IIHRDLKPEN
IVLQQGEQRL	IHKIIDLGYA	KELDQGSLCT	SFVGTLQYLA	PELLEQQKYT
VTVDYWSFGT	LAFECITGFR	PFLPNWQPVQ	WHSKVRQKSE	VDIVVSEDLN
GTVKFSSSLP	YPNNLNSVLA	ERLEKWLQLM	LMWHPRQRGT	DPTYGPNGCF
KALDDILNLK	LVHILNMVTG	TIHTYPVTED	ESLQSLKARI	QQDTGIPEED
QELLQEAGLA	LIPDKPATQC	ISDGKLNEGH	TLDMDLVFLF	DNSKITYETQ
ISPRPQPESV	SCILQEPKRN	LAFFQLRKVW	GQVWHSIQTL	KEDCNRLQQG
QRAAMMNLLR	NNSCLSKMKN	SMASMSQQLK	AKLDFFKTSI	QIDLEKYSEQ
TEFGITSDKL	LLAWREMEQA	VELCGRENEV	KLLVERMMAL	QTDIVDLQRS
PMGRKQGGTL	DDLEEQAREL	YRRLREKPRD	QRTEGDSQEM	VRLLLQAIQS
FEKKVRVIYT	QLSKTVVCKQ	KALELLPKVE	EVVSLMNEDE	KTVVRLQEKR
QKELWNLLKI	ACSKVRGPVS	GSPDSMNASR	LSQPGQLMSQ	PSTASNSLPE
PAKKSEELVA	EAHNLCTLLE	NAIQDTVREQ	DQSFTALDWS	WLQTEEEEHS
CLEQAS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

Woronicz J.D., Gao X., Cao Z., Rothe M., Goeddel D.V. (1997). IkappaB kinase-beta: NF-kappaB activation and complex formation with IkappaB kinase-alpha and NIK. Science. 278: 866—869. PMID 9346485 DOI:10.1126/science.278.5339.866
Hu M.C.-T., Wang Y.-P. (1998). IkappaB kinase-alpha and -beta genes are coexpressed in adult and embryonic tissues but localized to different human chromosomes. Gene. 222: 31—40. PMID 9813230 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00462-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mittal R., Peak-Chew S.Y., McMahon H.T. (2006). Acetylation of MEK2 and I kappa B kinase (IKK) activation loop residues by YopJ inhibits signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 18574—18579. PMID 17116858 DOI:10.1073/pnas.0608995103
Nemoto S., DiDonato J.A., Lin A. (1998). Coordinate regulation of IkappaB kinases by mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1 and NF-kappaB-inducing kinase. Mol. Cell. Biol. 18: 7336—7343. PMID 9819420 DOI:10.1128/MCB.18.12.7336
Cohen L., Henzel W.J., Baeuerle P.A. (1998). IKAP is a scaffold protein of the IkappaB kinase complex. Nature. 395: 292—296. PMID 9751059 DOI:10.1038/26254

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з IKBKB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5960 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O14920 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з IKBKB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Inhibitor of nuclear factor kappa B kinase subunit beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5960 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, O14920 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]