IK

IK (англ. IK cytokine, down-regulator of HLA II) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 557 амінокислот, а молекулярна маса — 65 602.

IK
Ідентифікатори
Символи	IK, CSA2, RED, IK cytokine, down-regulator of HLA II, RER, IK cytokine
Зовнішні ІД	OMIM: 600549 MGI: 1345142 HomoloGene: 36193 GeneCards: IK
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • nuclear speck • nuclear chromosome • mitotic spindle pole • spindle pole • нуклеоплазма • spliceosomal complex • хромосома • цитоплазма • цитоскелет • клітинне ядро • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • GO:0007067 мітоз • mitotic spindle assembly checkpoint signaling • protein localization to kinetochore • mRNA processing • Сплайсинг РНК • GO:0022415 viral process • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3550	24010
Ensembl	ENSG00000113141	ENSMUSG00000024474
UniProt	Q13123 Q95HA6	Q9Z1M8
RefSeq (мРНК)	NM_006083	NM_011879
RefSeq (білок)	NP_006074 NP_006074.2	NP_036009
Локус (UCSC)	Хр. 5: 140.65 – 140.66 Mb	Хр. 18: 36.88 – 36.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPERDSEPFS		NPLAPDGHDV		DDPHSFHQSK		LTNEDFRKLL		MTPRAAPTSA
PPSKSRHHEM		PREYNEDEDP		AARRRKKKSY		YAKLRQQEIE		RERELAEKYR
DRAKERRDGV		NKDYEETELI		STTANYRAVG		PTAEADKSAA		EKRRQLIQES
KFLGGDMEHT		HLVKGLDFAL		LQKVRAEIAS		KEKEEEELME		KPQKETKKDE
DPENKIEFKT		RLGRNVYRML		FKSKAYERNE		LFLPGRMAYV		VDLDDEYADT
DIPTTLIRSK		ADCPTMEAQT		TLTTNDIVIS		KLTQILSYLR		QGTRNKKLKK
KDKGKLEEKK		PPEADMNIFE		DIGDYVPSTT		KTPRDKERER		YRERERDRER
DRDRDRERER		ERDRERERER		DREREEEKKR		HSYFEKPKVD		DEPMDVDKGP
GSTKELIKSI		NEKFAGSAGW		EGTESLKKPE		DKKQLGDFFG		MSNSYAECYP
ATMDDMAVDS		DEEVDYSKMD		QGNKKGPLGR		WDFDTQEEYS		EYMNNKEALP
KAAFQYGIKM		SEGRKTRRFK		ETNDKAELDR		QWKKISAIIE		KRKKMEADGV
EVKRPKY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5